ОПРЕДЕЛЕНИЕ МУТАЦИЙ ПРОМОТОРА ГЕНА TERT В ОБРАЗЦАХ ГЛИОМ МЕТОДОМ АЛЛЕЛЬ-СПЕЦИФИЧНОЙ ГИБРИДИЗАЦИИ НА БИОЛОГИЧЕСКОМ МИКРОЧИПЕ

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Соматические мутации в промоторе гена обратной транскриптазы теломеразы (TERT) могут вызывать реактивацию фермента теломеразы, что стимулирует неопластические процессы в организме. Наиболее часто мутации C228T и C250T промотора гена TERT (TERTp) обнаруживают в глиомах головного мозга, для которых они выступают важными диагностическими и прогностическими маркерами. Для определения мутаций TERTp разработан подход, включающий амплификацию участка промотора и последующую гибридизацию c иммобилизованными зондами на биологическом микрочипе (биочипе). С использованием данного подхода проведено исследование мутационного статуса TERTp в 94 образцах глиом (астроцитома, олигодендроглиома, глиобластома). Для верификации результатов генотипирования использовали данные таргетного секвенирования на платформе Illumina и прямого секвенирования по Сэнгеру. Всего мутации TERTp были обнаружены в 62 из 94 образцов (66%), наиболее часто у пациентов с глиобластомой (71%). Мутация C228T (69%) встречалась значительно чаще по сравнению с мутацией C250T (31%). Результаты апробации биочипа на коллекции клинических образцов показывают, что он может быть использован в качестве удобного и надежного диагностического инструмента при генетическом анализе опухолей ЦНС.

Об авторах

В. О. Варачев

ФГБУН “Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта” РАН

Россия, 119991 Москва

И. О. Баринова

ФГБУН “Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта” РАН

Россия, 119991 Москва

О. Ю. Сусова

ФГБУ “Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина” Минздрава России

Россия, 115548 Москва

А. А. Митрофанов

ФГБУ “Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина” Минздрава России

Россия, 115548 Москва

С. А. Суржиков

ФГБУН “Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта” РАН

Россия, 119991 Москва

И. В. Гречишникова

ФГБУН “Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта” РАН

Россия, 119991 Москва

А. С. Заседателев

ФГБУН “Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта” РАН

Россия, 119991 Москва

А. В. Чудинов

ФГБУН “Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта” РАН

Россия, 119991 Москва

Т. В. Наседкина

ФГБУН “Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта” РАН

Email: tanased06@rambler.ru
Россия, 119991 Москва

Список литературы

  1. Jafri M.A., Ansari S.A., Alqahtani M.H., Shay J.W. // Genome Med. 2016. V. 8. P. 69. https://doi.org/10.1186/s13073-016-0324-x
  2. Gupta S., Vanderbilt C.M., Lin Y.T., Benhamida J.K., Jungbluth A.A., Rana S., Momeni-Boroujeni A., Chang J.C., Mcfarlane T., Salazar P., Mullaney K., Middha S., Zehir A., Gopalan A., Bale T.A., Ganly I., Arcila M.E., Benayed R., Berger M.F., Ladanyi M., Dogan S. // J. Mol. Diagn. 2021. V. 23. P. 253-263. https://doi.org/10.1016/j.jmoldx.2020.11.003
  3. Hafezi F., Perez Bercoff D. // Cells. 2020. V. 9. P. 749. https://doi.org/10.3390/cells9030749
  4. Louis D.N., Perry A., Wesseling P., Brat D.J., Cree I.A., Figarella-Branger D., Hawkins C., Ng H.K., Pfister S.M., Reifenberger G., Soffietti R., von Deimling A., Ellison D.W. // Neuro Oncol. 2021. V. 23. P. 1231- 1251. https://doi.org/10.1093/neuonc/noab106
  5. Hasanau T., Pisarev E., Kisil O., Nonoguchi N., Le Calvez-Kelm F., Zvereva M. // Biomedicines. 2022. V. 10. P. 728. https://doi.org/10.3390/biomedicines10030728
  6. Diplas B.H., Liu H., Yang R., Hansen L.J., Zachem A.L., Zhao F., Bigner D.D., McLendon R.E., Jiao Y., He Y., Waitkus M.S., Yan H. // Neuro Oncol. 2019. V. 21. P. 440-450. https://doi.org/10.1093/neuonc/noy167
  7. Fujioka Y., Hata N., Akagi Y., Kuga D., Hatae R., Sangatsuda Y., Michiwaki Y., Amemiya T., Takigawa K., Funakoshi Y., Sako A., Iwaki T., Iihara K., Mizoguchi M. // J. Neurooncol. 2021. V. 152. P. 47-54. https://doi.org/10.1007/s11060-020-03682-7
  8. Adachi J.I., Shirahata M., Suzuki T., Mishima K., Uchida E., Sasaki A., Nishikawa R. // Brain Tumor Pathol. 2021. V. 38. P. 201-209. https://doi.org/10.1007/s10014-021-00403-4
  9. Zacher A., Kaulich K., Stepanow S., Wolter M., Köhrer K., Felsberg J., Malzkorn B., Reifenberger G. // Brain Pathol. 2017. V. 27. P. 146-159. https://doi.org/10.1111/bpa.12367
  10. Varachev V.O., Guskov D.A., Shekhtman A.P., Rogozhin D.V., Polyakov S.A., Zacedatelev A.S., Chudinov A.V., Nasedkina T.V. // Russ. J. Bioorg. Chem. 2023. V. 49. P. 1137-1142. https://doi.org/10.1134/s1068162023050205
  11. Иконникова А.Ю., Шершов В.Е., Мороз Ю.В., Василисков В.А., Лапа С.А., Мифтахов Р.А., Кузнецова В.Е., Чудинов А.В., Наседкина Т.В. // Биофизика. 2021. Т. 6. С. 31-39. https://doi.org/10.31857/S000630292101004X
  12. Yuan Y., Qi C., Maling G., Xiang W., Yanhui L., Ruofei L., Yunhe M., Jiewen L., Qing M. // J. Clin. Neurosci. 2016. V. 26. P. 57-62. https://doi.org/10.1016/j.jocn.2015.05.066
  13. Huang D.S., Wang Z., He X.J., Diplas B.H., Yang R., Killela P.J., Meng Q., Ye Z.Y., Wang W., Jiang X.T., Xu L., He X.L., Zhao Z.S., Xu W.J., Wang H.J., Ma Y.Y., Xia Y.J., Li L., Zhang R.X., Jin T., Zhao Z.K., Xu J., Yu S., Wu F., Liang J., Wang S., Jiao Y., Yan H., Tao H.Q. // Eur. J. Cancer. 2015. V. 51. P. 969-976. https://doi.org/10.1016/j.ejca.2015.03.010
  14. Hewer E., Phour J., Gutt-Will M., Schucht P., Dettmer M.S., Vassella E.J. // Neuropathol. Exp. Neurol. 2020. V. 79. P. 430-436. https://doi.org/10.1093/jnen/nlaa004
  15. Li J., Han Z., Ma C., Chi H., Jia D., Zhang K., Feng Z., Han B., Qi M., Li G., Li X., Xue H. // Ann. Clin. Transl. Neurol. 2024. V. 11. P. 2176-2187. https://doi.org/10.1002/acn3.52138
  16. Варачев В.О., Сусова О.Ю., Митрофанов А.А., Краснов Г.С., Насхлеташвили Д.Р., Аммур Ю.И., Бежанова С.Д., Севян Н.В., Прозоренко Е.В., Бекяшев А.Х., Наседкина Т.В. // Усп. мол. онкологии. 2024. Т. 11. С. 68-78. https://doi.org/10.17650/2313-805X-2024-11-3-68-78
  17. Краснов Г.С., Гукасян Л.Г., Абрамов И.С., Наседкина Т.В. // Мол. биология. 2021. Т. 5. С. 829-845. https://doi.org/10.31857/S0026898421050050

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).