Отправить статью по E-mail 
Особенности трехмерной реконструкции спиралей по данным малоуглового рентгеновского рассеяния
- Авторы: Григорьев В.А.1, Конарев П.В.1, Волков В.В.1
-
Учреждения:
- Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова Курчатовского комплекса кристаллографии и фотоники НИЦ “Курчатовский институт”
- Выпуск: Том 69, № 6 (2024)
- Страницы: 971-980
- Раздел: СТРУКТУРА МАКРОМОЛЕКУЛЯРНЫХ СОЕДИНЕНИЙ
- URL: https://ogarev-online.ru/0023-4761/article/view/272018
- DOI: https://doi.org/10.31857/S0023476124060063
- EDN: https://elibrary.ru/YHUDKD
- ID: 272018
Цитировать
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Аннотация
Спиральные частицы представляют интерес из-за схожести с реальными наноструктурами, образующимися в процессах самоорганизации биополимеров (например каррагинанов, ДНК и пр.). С другой стороны, определение структурных параметров таких частиц по данным малоуглового рассеяния затруднено из-за плохой обусловленности обратной задачи. Это показывает практика применения известных программ моделирования шариковыми структурами. Рассмотрены модификация алгоритма поиска в ограниченной области пространства и поведение решений в зависимости от величин параметров целевой функции, отвечающих за связность структуры, типа взвешивания кривой интенсивности рассеяния, ширины углового диапазона данных. Для статистической оценки устойчивости решений применен режим последовательного поиска модели при варьировании величин вкладов штрафных членов. Определены эмпирические зависимости оптимальных значений параметров поиска в зависимости от параметров кривой распределения парных расстояний.
Полный текст
Об авторах
В. А. Григорьев
Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова Курчатовского комплекса кристаллографии и фотоники НИЦ “Курчатовский институт”
Автор, ответственный за переписку.
Email: vasiliy.grigorev.1996@mail.ru
Россия, Москва
П. В. Конарев
Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова Курчатовского комплекса кристаллографии и фотоники НИЦ “Курчатовский институт”
Email: vasiliy.grigorev.1996@mail.ru
Россия, Москва
В. В. Волков
Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова Курчатовского комплекса кристаллографии и фотоники НИЦ “Курчатовский институт”
Email: vasiliy.grigorev.1996@mail.ru
Россия, Москва
Список литературы
- Свергун Д.И., Фейгин Л.А. Рентгеновское и малоугловое рассеяние. М.: Наука, 1986. 280 с.
- Svergun D.I., Stuhrmann H.B. // Acta Cryst. A. 1991. V. 47. P. 736. https://doi.org/10.1107/S0108767391006414
- Svergun D.I., Volkov V.V., Kozin M.B. et al. // Acta Cryst. A. 1996. V. 52. P. 419. https://doi.org/10.1107/S0108767396000177
- He H., Liu C., Liu H. // iScience. 2020. V. 23. 100906.
- Svergun D.I. // Biophys J. 1999. V. 78. P. 2879. https://doi.org/10.1016/S0006 3495(99)77443-6
- Franke D., Svergun D.I. // J. Appl. Cryst. 2009. V. 42. P. 342. https://doi.org/10.1107/S0021889809000338
- Kirkpatrick S., Gelatt C.D., Vecchi M.P. // Science. 1983. V. 220. P. 671. https://doi.org/10.1126/science.220.4598.671
- Григорьев В.А., Конарев П.В., Волков В.В. // Кристаллография. 2023. Т. 68. С. 941. https://doi.org/10.31857/S0023476123600295
- Волков В.В. // Кристаллография. 2021. Т. 66. С. 793. https://doi.org/10.31857/S0023476121050234
- Григорьев В.А., Конарев П.В., Волков В.В. // Успехи в химии и химической технологии. 2022. Т. 36. С. 53
- Rees D.A. Polysaccharides Shapes. London: Chapman and Hall, 1977. 80 p.
- Shtykova E.V., Volkov V.V., Konarev P.V. et al. // J. Appl. Cryst. 2003. V. 36. P. 669. https://doi.org/10.1107/S0021889803006198
- Shannon C.E., Weaver W. The Mathematical Theory of Communication. University of Illinois Press, 1949. 125 p.
- Kozin M., Svergun D. // J. Appl. Cryst. 2001. V. 34. P. 33. https://doi.org/10.1107/S0021889800014126
- Taha AA., Hanbury A. // BMC Med Imaging. 2015. V. 15. P. 29. https://doi.org/10.1186/s12880-015-0068-x
- Svergun D.I. // J. Appl. Cryst. 1992. V. 25. P. 495.
Дополнительные файлы
