Открытый доступ Открытый доступ  Доступ закрыт Доступ предоставлен  Доступ закрыт Только для подписчиков

Том 21, № 3 (2023)

Обложка

Весь выпуск

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Генетические основы эволюции экосистем

Сравнение изменчивости и азотфиксирующей активности штаммов ризобий, выделенных из клубеньков клевера гибридного и козлятника восточного на разных стадиях вегетации растений

Баймиев А.Х., Коряков И.С., Акимова Е.С., Владимирова А.А., Матниязов Р.Т., Баймиев А.Х.

Аннотация

Начало жизненного цикла бобового растения в естественных ареалах их произрастания обычно связано со взаимодействием с клубеньковыми бактериями с целью образования азотфиксирующего симбиоза. При этом растению за короткий промежуток времени необходимо выбрать подходящих для себя микросимбионтов. Поскольку в ризосфере бобовых формируется большое разнообразие штаммов ризобий, отличающихся по своим характеристикам, сделанный макросимбионтом выбор в дальнейшем будет оказывать влияние и на его продуктивность. В данной работе были показаны особенности разнообразия микроорганизмов, формирующих клубеньки на разных этапах развития растений. Установлено, что полиморфизм клубеньковых бактерий исследованных бобовых на разных стадиях их вегетации имеет определенную закономерность. На раннем этапе развития в их клубеньках можно обнаружить наиболее генетически разнородные микроорганизмы, которые отличаются друг от друга также по показателям азотфиксации. К середине же вегетационного периода уровни азотфиксирующей активности бактерий и их полиморфизма выравниваются. Показано, что по симбиотическим генам ризобии растений из одной популяции идентичны, несмотря на имеющееся генетическое разнообразие. Скорее всего, гетерогенность исследуемых микросимбионтов связана не с полиморфными вариантами данных генов, а с их составом или же с различиями в других регионах генома, имеющих влияние на азотфиксирующую активность штаммов. Мы предполагаем, что пластичность генома ризобий дает растению-хозяину возможность более гибко настраивать свой азотфиксирующий аппарат на изменения условий произрастания.

Экологическая генетика. 2023;21(3):207-217
pages 207-217 views

Эффекты повышенной освещенности на реакцию растений Arabidopsis thaliana с подавлением экспрессии гена альтернативной оксидазы митохондрий АОХ1а

Гармаш Е.В., Ядрихинский К.В., Шелякин М.А., Белых Е.С.

Аннотация

Актуальность. Растения как прикрепленные организмы развили в процессе эволюции биохимические стратегии защиты от избытка световой энергии. Альтернативная оксидаза митохондрий (АОХ) может участвовать в окислении образующихся в хлоропластах восстановителей, способствуя оптимизации протекания фотосинтеза и защите клетки от фотоповреждений.

Цель — исследовать влияние повышенной освещенности на дыхание и относительное содержание транскриптов ряда генов в растениях Arabidopsis thaliana линии с нокаутом гена АОХ — АОХ1а (aox1a) — и провести сравнение с реакцией линии, трансформированной антисмысловой копией гена АОХ1а (AS-12).

Материалы и методы. Четырехнедельные растения, выращенные при 90 мкмоль/(м2 · с), подвергали воздействию света высокой интенсивности, 400 мкмоль/(м2 · с), в течение 8 ч. В ходе эксперимента определяли активность дыхательных путей, относительное содержание транскриптов генов и содержание супероксида.

Результаты. Растения линии aox1a характеризовались повышением уровня транскриптов АОХ1с, по сравнению с линией AS-12, в которой отмечено увеличение транскриптов АОХ1d. При действии повышенной освещенности активность общего и альтернативного дыхания в листьях линии aox1a не изменялась, в отличие от растений дикого типа (Col-0) и линии AS-12, которые дышали более интенсивно. В нокаутной линии также обнаружено повышенное содержание транскриптов только SAPX и CHS, тогда как в растениях Col-0 и AS-12 выявлено компенсаторное увеличение относительного количества мРНК ряда «защитных» генов.

Выводы. Таким образом, линия aox1a характеризовалась слабым компенсаторным эффектом со стороны активации «защитных» систем, что указывает на низкую способность нокаутных растений противостоять стрессу, по сравнению с линией AS-12. Полученные результаты указывают на ведущую роль АОХ в реакции дыхания на световой стресс; могут быть использованы для изучения сигнальных путей регуляции экспрессии АОХ1а.

Экологическая генетика. 2023;21(3):219-234
pages 219-234 views

Анализ генетического разнообразия айрширского скота России. Сообщение 2. Анализ генома на основе данных распределения ROH-паттернов коров айрширской породы

Рябова А.Е., Позовникова М.В., Дементьева Н.В., Щербаков Ю.С., Тулинова О.В., Романова Е.А., Азовцева А.И.

Аннотация

Актуальность. Анализ распределения ROH — важное направление в программах сохранения генетических ресурсов крупного рогатого скота. Характеристика ROH-островков позволяет выявить генетические факторы, оказывающие влияние на продуктивные качества молочного скота.

Цель — анализ внутрипородного генетического разнообразия и структуры популяции на основе данных распределения паттернов гомозиготности и идентификация локусов, ассоциированных с интенсивностью отбора по хозяйственно-полезным признакам у коров айрширской породы.

Материалы и методы. Данные о распределении ROH были получены на основании полногеномного генотипирования на ДНК-чипах Illumina BovineSNP50 (50K) (Illumina Inc., США). Объектом исследования была ДНК коров айрширской породы (600 голов), которые принадлежали хозяйствам с различным уровнем селекционно-племенной работы.

Результаты. Результаты наших исследований показали в целом схожий уровень инбредности анализируемых стад айрширского скота. Однородность популяции подтверждается большим числом животных (72,83 %) со значениями FROH в интервале от 0,10 до 0,20. Кластерный анализ выявил консолидированные группы особей, что обусловлено происхождением их предков. Обнаруженные ROH-паттерны включали 268 генов, 32 из которых вовлечены в регуляцию синтеза белково-жировых компонентов молока.

Выводы. Полученные результаты могут быть использованы в программах селекции айрширского скота, разводимого в России.

Экологическая генетика. 2023;21(3):235-248
pages 235-248 views

Генетическая токсикология

Оценка потенциальной мутагенной активности флоротаннин-содержащих экстрактов трех видов бурых водорослей

Тараховская Е.Р., Исламова Р.Т., Замяткина Е.Б., Степченкова Е.И.

Аннотация

Актуальность. Флоротаннины — это уникальные фенольные метаболиты бурых водорослей. Эти соединения исследуются на предмет возможного применения в медицине, поскольку имеют значительную биологическую активность. Неизученным аспектом на данный момент остается потенциальная генотоксичность флоротаннинов.

Цель — оценка мутагенной активности внутриклеточных и связанных с клеточной стенкой флоротаннинов трех видов бурых водорослей.

Материалы и методы. Флоротаннин-содержащие экстракты Desmarestia aculeata, Fucus serratus и Ectocarpus siliculosus оценивали на мутагенность в тесте Эймса на трех штаммах Salmonella typhimurium (TA97, TA98 и TA100) с метаболической активацией и без нее.

Результаты. Внутриклеточные флоротаннины всех водорослей характеризуются относительно низкими значениями минимальной ингибирующей концентрации в отношении S. typhimurium (20–30 мкг/мл). Внутриклеточные флоротаннины F. serratus и связанные с клеточной стенкой полифенолы E. siliculosus показали умеренную мутагенную активность в тесте Эймса: они индуцировали мутации сдвига рамки считывания, при этом число ревертантов His+ более чем вдвое превышало контроль. Экстракты D. aculeata не проявили мутагенной активности.

Заключение. Флоротаннины D. aculeata наиболее перспективны для использования в медицине, поскольку имеют наибольшую антибиотическую активность и не проявляют мутагенности.

Экологическая генетика. 2023;21(3):249-260
pages 249-260 views

Экологическая генетика человека

Роль полиморфизма редокс-чувствительных генов в механизмах окислительного стресса при ожирении и метаболических заболеваниях

Шкурат М.А., Машкина Е.В., Милютина Н.П., Шкурат Т.П.

Аннотация

В обзоре обобщены представления о роли полиморфизма редокс-чувствительных генов, регулирующих развитие окислительного стресса, при ожирении и ассоциированных метаболических заболеваниях. Рассмотрена концепция окислительного стресса, активированных кислородных метаболитов (АКМ), к которым относятся активные формы кислорода, азота и хлора, дано представление об антиоксидантной системе и ее ферментативном звене. Показана важная роль полиморфизма генов АКМ-продуцирующих ферментов — CYBA, CYBB, MT-ND1/2/4L, MT-CO1/3, XOR, CYP, NOS2/3, MPO — в индукции окислительного стресса при ожирении. Подчеркивается дуализм АКМ при ожирении, с одной стороны, необходимых для нормального адипогенеза и сигналинга, а с другой — выполняющих триггерную роль в развитии окислительного стресса. Продемонстрировано, что дисбаланс в антиоксидантной системе при ожирении и метаболических расстройствах может быть связан с вариабельностью генов ключевых антиоксидантных ферментов и белков — SOD1/2/3, CAT, GPX1-8, GSR, GSTP1, GSTM1, GSTT1, PRDX3, TXNIP, HMOX1, NQO1, NFE2L2, KEAP1. Показана критическая роль полиморфизма гена фактора транскрипции Nrf2, главного регулятора редокс-гомеостаза в физиологических условиях и при ожирении. Продемонстрировано, что нарушение редокс-гомеостаза вследствие вариабельности генов системы оксиданты – антиоксиданты способствует развитию патологического фенотипа ожирения. Понимание генетических механизмов, лежащих в основе окислительного стресса при ожирении и метаболических заболеваниях, необходимо для расширения знаний о механизмах патогенеза данных заболеваний и разработки эффективных способов их коррекции.

Экологическая генетика. 2023;21(3):261-287
pages 261-287 views


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».