Улучшает ли качество определения злокачественных изменений молочной железы агрегация результатов работы ИИ-системы с помощью метамодели?

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

ОБОСНОВАНИЕ. Нейронные сети для анализа маммограмм обычно решают задачу детекции или сегментации областей интереса. Однако при тестировании таких систем в первую очередь обычно оценивают их общую способность определять вероятность наличия злокачественных изменений ― по вероятности от 0 до 100% или по шкале Bi-Rads. В большинстве случаев эту вероятность определяют как максимальную вероятность наличия злокачественного объекта на обеих проекциях [1–3].

ЦЕЛЬ ― проверить, может ли более сложная агрегация результатов работы ИИ-системы с помощью метамодели улучшить результаты определения вероятности злокачественных изменений.

МЕТОДЫ. Для данного анализа использовалась ИИ-система «Цельс», маммография версии 0.17.0. Для сравнения выбрали набор данных, состоящий из снимков 867 молочных желёз (Bi-Rads 1 ― 257, 2 ― 495, 3 ― 77, 4–5 ― 38), собранных из медицинских учреждений разных регионов России. В качестве целевой переменной использовали заключение врача по шкале Bi-Rads. В качестве метрики использовали ROC-AUC (площадь под кривой ROC), рассчитанную двумя способами ― с включением Bi-Rads-3 в патологическую категорию и в здоровую соответственно.

Сравнивали два метода расчёта вероятности злокачественных изменений молочной железы. Предварительно обе проекции обработали нейронной сетью и для каждой железы получили список обнаруженных объектов с соответствующими типами объектов и вероятностями их присутствия на изображении.

  1. В первом методе вероятность злокачественных изменений определялась как сумма максимальных вероятностей обнаруженных злокачественных объектов (злокачественные образования и кальцинаты) по проекциям CC и MLO.
  2. Для второго метода обучили специальную метамодель, которая агрегирует различные результаты работы нейронной сети ― обнаруженные объекты и их вероятности на обеих проекциях, предсказанную плотность железы, степень качества изображения и другие. Метамодель обучали на отдельном датасете, не используемом в данном исследовании. Для данного датасета сгенерировали ряд «фич» (признаков), по которым и производилось обучение. Эти «фичи» используют всю информацию, сгенерированную нейронной сетью для обеих проекций. Подробное описание этих «фичей» остаётся за рамками этого тезиса.

РЕЗУЛЬТАТЫ. Первый метод продемонстрировал следующие результаты по метрике ROC-AUC: 0.857 (с исключением Bi-Rads-3 из патологической категории) и 0.76 (с включением). Второй метод показал результаты 0.881 и 0.794. Статистический анализ с помощью бутстрэппинга демонстрирует значимость этих результатов.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ. Использование метамодели для агрегации результатов работы нейронной сети позволяет значительно улучшить качество определения общей вероятности наличия злокачественных изменений у пациента. Кроме этого, использование специальных методов интерпретации (например, Shap) [4] позволяет более точно понять, почему каждому пациенту была присвоена та или иная вероятность риска.

Об авторах

Е. Д. Никитин

Медицинские Скрининг Системы

Автор, ответственный за переписку.
Email: e.nikitin@celsus.ai
Россия, Калуга

Список литературы

  1. Ribli D, Horváth A, Unger Z, Pollner P, Csabai I. Detecting and classifying lesions in mammograms with deep learning. Sci Rep. 2018;8(1):4165. doi: 10.1038/s41598-018-22437-z
  2. Jung H, Kim B, Lee I, et al. Detection of masses in mammograms using a one-stage object detector based on a deep convolutional neural network. PLoS One. 2018;13(9):e0203355. doi: 10.1371/journal.pone.0203355
  3. Xiao L, Zhu Ch, Liu J, et al. Learning from suspected target: Bootstrapping performance for breast cancer detection in mammography. In: Proceedings of the International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention. Cham: Springer; 2019. doi: 10.1007/978-3-030-32226-7_52
  4. Lundberg SM, Lee S-I. A unified approach to interpreting model predictions. In: Advances in Neural Information Processing Systems. 2017:4765–4774. Available from: https://www.researchgate.net/publication/317062430_A_Unified_Approach_to_Interpreting_Model_Predictions

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Никитин Е.Д., 2022

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».