Создание номограмм для оценки риска неблагоприятного клинического исхода


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Представлена методика по разработке номограмм для оценки и стратификации риска определенного клинического исхода на основе созданного виртуального набора данных с использованием программной среды R. Виртуальный набор данных включал входные числовые и факторные переменные (типы переменных соответствуют документации программной среды R) и исход. Для количественных переменных были вычислены описательные статистики на всех уровнях переменной исхода, а для факторных переменных были построены мозаичные диаграммы. В качестве модели, описывающей ассоциацию входных переменных с исходом, была использована модель логистической регрессии. Для валидации и оценки производительности модели применен метод бутстрапа. Рассчитанные показатели валидности показали приемлемую дискриминационную способность прогностической модели. Статистическая калибровка продемонстрировала близость калибровочной кривой модели к идеальной калибровочной кривой. На основе коэффициентов логистической регрессии построена номограмма, по которой рассчитывалось значение риска определенного исхода для каждого оцениваемого субъекта (пациента). Показано, что с помощью представленной методики можно эффективно стратифицировать пациентов по риску неблагоприятного исхода, адекватно изменяя таким образом тактику диагностики и лечения. Использование номограммы значительно упрощает оценку риска и может быть использовано в бумажном виде в качестве дополнения к протоколу обследования пациента. В тексте статьи представлены коды языка программирования R с пояснениями.

Об авторах

А А Корнеенков

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

С Г Кузьмин

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

В Б Дергачев

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

Д Н Борисов

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Корнеенков, А.А. Использование модифицированной процедуры последовательного распознавания Вальда для определения исхода оперативного лечения у пациентов с болезнью Меньера / А.А. Корнеенков [и др.] // Росс. ото- риноларингол. - 2018. - № 3 (94). - С. 54-59.
  2. Светуньков, И.С. Методы социально-экономического прогнозирования в 2 т. Т. 2 Модели и методы: учебник и практикум для академического бакалавриата / И.С. Светуньков, С.Г. Светуньков. - М.: Издательство Юрайт, 2018. - C. 17-25.
  3. Кабаков, Р.И. R в действии. Анализ и визуализация данных в программе R / И. Кабаков; пер. с англ. П.А. Волковой. - М.: ДМК Прес, 2016. - 588 с.
  4. Cleveland, W.S. Robust Locally Weighted Regression and Smoothing Scatterplots / W.S. Cleveland // American Statistical Association. - 1979. - Vol. 74, № 368. - P. 829-836.
  5. Efron, B. Bootstrap methods: Another look at the jackknife / B. Efron // Ann. Statist. - 1979. - № 7. - P. 1-26.
  6. Hartigan, J.A. Mosaics for Contingency Tables / J.A. Hartigan, B. Kleiner // Computer Science and Statistics: Proceedings of the 13th Symposium on the Interface. - New York: Springer, 1981. - P. 268-273.
  7. Harrell, F.E.Jr. Regression Modeling Strategies / E.F.Jr. Harrell. - Switzerland: Springer International Publishing, 2015. - 582 p.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Корнеенков А.А., Кузьмин С.Г., Дергачев В.Б., Борисов Д.Н., 2019

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».