Создание номограмм для оценки риска неблагоприятного клинического исхода


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Представлена методика по разработке номограмм для оценки и стратификации риска определенного клинического исхода на основе созданного виртуального набора данных с использованием программной среды R. Виртуальный набор данных включал входные числовые и факторные переменные (типы переменных соответствуют документации программной среды R) и исход. Для количественных переменных были вычислены описательные статистики на всех уровнях переменной исхода, а для факторных переменных были построены мозаичные диаграммы. В качестве модели, описывающей ассоциацию входных переменных с исходом, была использована модель логистической регрессии. Для валидации и оценки производительности модели применен метод бутстрапа. Рассчитанные показатели валидности показали приемлемую дискриминационную способность прогностической модели. Статистическая калибровка продемонстрировала близость калибровочной кривой модели к идеальной калибровочной кривой. На основе коэффициентов логистической регрессии построена номограмма, по которой рассчитывалось значение риска определенного исхода для каждого оцениваемого субъекта (пациента). Показано, что с помощью представленной методики можно эффективно стратифицировать пациентов по риску неблагоприятного исхода, адекватно изменяя таким образом тактику диагностики и лечения. Использование номограммы значительно упрощает оценку риска и может быть использовано в бумажном виде в качестве дополнения к протоколу обследования пациента. В тексте статьи представлены коды языка программирования R с пояснениями.

Об авторах

А А Корнеенков

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

С Г Кузьмин

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

В Б Дергачев

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

Д Н Борисов

Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова

Email: vmeda-nio@mil.ru
Санкт-Петербург

Список литературы

  1. Корнеенков, А.А. Использование модифицированной процедуры последовательного распознавания Вальда для определения исхода оперативного лечения у пациентов с болезнью Меньера / А.А. Корнеенков [и др.] // Росс. ото- риноларингол. - 2018. - № 3 (94). - С. 54-59.
  2. Светуньков, И.С. Методы социально-экономического прогнозирования в 2 т. Т. 2 Модели и методы: учебник и практикум для академического бакалавриата / И.С. Светуньков, С.Г. Светуньков. - М.: Издательство Юрайт, 2018. - C. 17-25.
  3. Кабаков, Р.И. R в действии. Анализ и визуализация данных в программе R / И. Кабаков; пер. с англ. П.А. Волковой. - М.: ДМК Прес, 2016. - 588 с.
  4. Cleveland, W.S. Robust Locally Weighted Regression and Smoothing Scatterplots / W.S. Cleveland // American Statistical Association. - 1979. - Vol. 74, № 368. - P. 829-836.
  5. Efron, B. Bootstrap methods: Another look at the jackknife / B. Efron // Ann. Statist. - 1979. - № 7. - P. 1-26.
  6. Hartigan, J.A. Mosaics for Contingency Tables / J.A. Hartigan, B. Kleiner // Computer Science and Statistics: Proceedings of the 13th Symposium on the Interface. - New York: Springer, 1981. - P. 268-273.
  7. Harrell, F.E.Jr. Regression Modeling Strategies / E.F.Jr. Harrell. - Switzerland: Springer International Publishing, 2015. - 582 p.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Корнеенков А.А., Кузьмин С.Г., Дергачев В.Б., Борисов Д.Н., 2019

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных

 

Используя сайт https://journals.rcsi.science, я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных») даю согласие на обработку персональных данных на этом сайте (текст Согласия) и на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика» (текст Согласия).