Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Vibrio Cholerae NON-O1/NON-O139, выделенных из балластных вод судов и акватории портов Ростовской области


Цитировать

Полный текст

Аннотация

В данной работе приведены результаты анализа присутствия в геномах штаммов Vibrio cholerae non-O1/non-O139, выделенных из судовых балластных вод и прибрежной зоны Таганрогского залива, нуклеотидных последовательностей интегронов класса 1 (In1) и интегративных конъюгативных элементов семейства SXT/R391. Интактный фрагмент З’-консервативного сегмента In1 (qacEdeltal-sul) детектирован в 3 штаммах (33, 59, 182), тогда как в штаммах V.cholerae 28 и 52 выявлены вероятные изменения последовательности-мишени (дупликация и делеция соответственно). Фрагмент гена интегразы int SXTSXT/R391 обнаружен в 7 из 10 исследованных штаммов. Группы штаммов № 27, 36, 38, 117 и № 59, 182 принадлежат к двум более часто встречаемым генотипам и идентичны в пределах групп по исследованным генетическим маркерам, тогда как остальные изоляты характеризуются уникальными генотипами, что указывает на их различные источники происхождения.

Об авторах

И. Б Захарова

ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора

400131, г. Волгоград

С. Ю Водяницкая

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора

344002, г. Ростов-на-Дону

М. В Подшивалова

ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора

400131, г. Волгоград

В. Д Кругликов

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора

344002, г. Ростов-на-Дону

И. В Архангельская

ФКУЗ «Ростовский-на-Дону противочумный институт» Роспотребнадзора

344002, г. Ростов-на-Дону

Д. В Викторов

ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора

400131, г. Волгоград

Список литературы

  1. Rodríguez-Blanco A., Lemos M., Osorio C. Integrating conjugative elements as vectors of antibiotic, mercury, and quaternary ammonium compound resistance in marine aquaculture environments. Antimicrob. Agents Chemother. 2012; 56(5): 2619-26.
  2. Водяницкая С.Ю., Лях О.В. Разработка способов отбора балластной воды на судах смешанного «река-море» плавания для исследования на холеру. Здоровье населения и среда обитания. 2014; 1: 37-40.
  3. Методические указания «Лабораторная диагностика холеры (МУК 4.2.2218-07)». М.; 2007.
  4. Mazel D. Integrons: agents of bacterial evolution. Nature Rev. Microbiol. 2006; 4: 608-20.
  5. Wozniak R., Fouts D., Spagnoletti M., et al. Comparative ICE genomics: insights into the evolution of the SXT/R391 family of ICEs. PLoS Genet. 2009; 5 (12): e1000786. doi: 10.1371/journal.pgen.1000786.
  6. Подшивалова М.В., Кузютина Ю.А., Захарова И.Б., Лопастейская Я.А., Викторов Д.В. Характеристика антибиотикорезистентных штаммов Vibrio cholerae, несущих интегративные конъюгативные элементы SXT типа. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014; 18 (3): 34-9.
  7. Сустретова Н.В. Обеспечение экологической безопасности балластных вод на судах смешанного плавания «река-море»: Дисс. ... канд. техн. наук. Н. Новгород; 2011.
  8. Водяницкая С.Ю., Лях О.В., Ломов Ю.М., Рыжков Ю.В., Иванова Н.Г., Иванова А.И. и др. Противоэпидемические (профилактические) мероприятия при выделении возбудителей холеры из судовых балластных вод. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2014; 2 (75): 40-4.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО "Эко-вектор", 2015


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».