Полиморфизм гена il 28B и прогноз эффективности противовирусной терапии при вирусном гепатите с в Узбекистане


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. Ассоциацией по исследованиям полного генома было выявлено прогностическое значение полиморфизма, связанного с однонуклеотидными заменами (SNP) в геноме человека и расположенных в участке гена IL28B/IFNL3. В дальнейшем также были выявлены SNP в области гена IFNL4 и обнаружена корреляция между популяцией и спонтанным элиминированием ВГС-инфекции. Методы. В исследованиях использовался материал от 135 ВГС-инфицированных лиц, проживающих на территории Узбекистана. ДНК выделяли из мононуклеарных клеток периферической крови (PBMC), далее генотипирование SNP участка гена IFNL3 (rs8099917, rs12979860) проводили тремя методами: Invader Plus Assay, TaqMan Assay и прямым секвенированием. Участок гена IFNL4 (ss469415590) секвенировали. Результаты. Из 135 обследованных пациентов, получавших 24 и 48 нед противовирусное лечение по стандартной схеме Peg-IFN-a в сочетании с RBV, 87,4% относились к центрально-азиатской (ЦЛ) этнической группе и 12,6% - к восточно-европейской (ВЕ). Среди обследованных не наблюдался вирусологический ответ на противовирусную терапию у 21,2% ЦА-группе и 35,3% ВЕ (р < 0,32). Высокая ассоциация SNP rs12979860 наблюдалась при тестировании всех образцов с устойчивым противовирусным ответом на терапию (OR 5,2; 95% CI 1,9-14.6; p < 0,004), однако SNP rs8099917 показало высокую прогностическую значимость только среди ЦА-группы (OR 6,9; 95% CI 2,6-18,0; p < 0,002). Частота аллелей IFNL4 SNP rs469415590 встречалась идентично SNP rs12979860 во всех исследованных образцах. Заключение. Для прогноза исхода противовирусной терапии при вирусном гепатите С среди популяций ЦА, в качестве маркеров генетических факторов могут быть использованы SNP областей генов IFNL3 и IFNL4.

Об авторах

Д. Э Секлер

НИИ вирусологии, МЗ РУз

Email: dildora@gmail.com
канд. мед. наук, ст. науч. сотрудник, руководитель группы в проекте «Определение резистентности к препаратам АРВТ у ВИЧ-инфицированных» 100194, Ташкент, Узбекистан, массив Юнус-Абад, квартал 3, ул. Янгишахар, 7а

Д. М Худайберганова

НИИ вирусологии, МЗ РУз

Email: mail2dinara@gmail.com
стажер-исследователь 100194, Ташкент, Узбекистан, массив Юнус-Абад, квартал 3, ул. Янгишахар, 7а

Р. Р Латыпов

НИИ вирусологии, МЗ РУз

Email: renatlatip@gmail.com
зам. директора по научно-исследовательской работе 100194, Ташкент, Узбекистан, массив Юнус-Абад, квартал 3, ул. Янгишахар, 7а

Г. З Усманова

НИИ вирусологии, МЗ РУз

зав. отд-нием гепатологии 100194, Ташкент, Узбекистан, массив Юнус-Абад, квартал 3, ул. Янгишахар, 7а

М. И Рахманов

НИИ вирусологии, МЗ РУз

канд. мед. наук, зам. гл. врача клиники 100194, Ташкент, Узбекистан, массив Юнус-Абад, квартал 3, ул. Янгишахар, 7а

Э. И Мусабаев

НИИ вирусологии, МЗ РУз

Email: drmusabaev@rambler.ru
доктор мед. наук, проф., директор НИИ вирусологии 100194, Ташкент, Узбекистан, массив Юнус-Абад, квартал 3, ул. Янгишахар, 7а

Список литературы

  1. Hanafiah K.M., Groeger J., Flaxman A.D., Wiersma S.T. Global epidemiology of hepatitis C virus infection: New estimates of age-specific antibody to hepatitis C virus seroprevalence. Hepatology. 2013; 57: 1333-42.
  2. Bernhardt S., Rutter K., Stattermayer A. 1 F., Ferenci P. Revisiting the predictors of a sustained virologic response in the era of direct-acting antiviral therapy for hepatitis C virus. Clin. Infect. Dis. 2013; 56: 118-22.
  3. Ghany M.G., Strader D.B., Thomas D.L., Seeff L.B. Diagnosis, management,and treatment of hepatitis C: an update. Hepatology. 2009; 49: 1335-74.
  4. Tanaka Y., Nishida N., Sugiyama M., Tokunaga K., Mizokami M. lambda- interferons and the single nucleotide polymorphisms: A milestone to tailor-made therapy for chronic hepatitis C. Hepatol. Res. 2010; 40: 449-60.
  5. Hayes C.N., Imamura M., Aikata H., Chayama K. Genetics of IL28B and HCV-response to infection and treatment. Nat. Rev. Gastroenterol. Hepatol 2012; 9: 406-17.
  6. Hayes C.N., Kobayashi M., Akuta N., Suzuki F., Kumada H. et al. HCV substitutions and IL28B polymorphisms on outcome of peg-interferon plus ribavirin combination therapy. Gut. 2011; 60: 261-7.
  7. Ge D., Fellay J., Thompson A.J., Simon J.S., Shianna K.V. et al. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatmentinduced viral clearance. Nature. 2009; 461: 399-401.
  8. Suppiah V., Moldovan M., Ahlenstiel G., Berg T., Weltman M. et al. IL28B is associated with response to chronic hepatitis C interferon-alpha and ribavirin therapy. Nat. Genet. 2009; 41: 1100-4.
  9. Tanaka Y., Nishida N., Sugiyama M., Kurosaki M., Matsuura K. et al. Genome-wide association of IL28B with response to pegylated interferon-alpha and ribavirin therapy for chronic hepatitis C. Nat. Genet. 2009; 41: 1105-9.
  10. Rauch A., Kutalik Z., Descombes P.1., Cai T., Di Iulio J. et al. Genetic variation in IL28B is associated with chronic hepatitis C and treatment failure: a genome wide association study. Gastroenterology. 2010; 138: 1337-8.
  11. Prokunina-Olsson L., Muchmore B., Tang W., Pfeiffer R.M., Park H. et al. A variant upstream of IFNL3 (IL28B) creating a new interferon gene IFNL4 is associated with impaired clearance of hepatitis C virus. Nat. Genet. 2013; 45: 164-71.
  12. Clark P.J., Thompson A.J., McHutchison J.G. IL28B genomicbased treatment paradigms for patients with chronic hepatitis C infection: the future of personalized HCV therapies. Am. J. Gastroenterol. 2011; 106: 38-45.
  13. Clark P.J., Thompson A.J. Host genomics and HCV treatment response. J. Gastroenterol. Hepatol. 2012; 27: 212-22.
  14. Stattermayer A.F., Strassl R., Maieron A., Rutter K., Stauber R. et al. Polymorphisms of interferon-74 and IL28B - effects on treatment response to interferon/ribavirin in patients with chronic hepatitis C. Aliment. Pharmacol. Ther. 2014; 39: 104-11.
  15. Covolo L., Bibert S., Donato F., Bochud P.-Y., Lagging M. et al. The novel ss469415590 variant predicts virological response to therapy in patients with chronic hepatitis C virus type 1 infection. Aliment. Pharmacol. Ther. 2013; 1-9.
  16. Franco S., Aparicio E., Parera M., Clotet B., Tural C. et al. IFNL4 ss469415590 variant is a better predictor than ILF3 (IL28B) rs12979860 of pegylated interferon-alpha/ribavirin therapy failure in hepatitis C virus/HIV-1 coinfected patients. AIDS. 2013; 131-6.
  17. Kramer B., Nischalke H.D., Boesecke 1 C., Ingiliz P., Voigt E. et al. Variation in IFNL4 genotype and response to interferon-based therapy of hepatitis C in HIV positive patients with acute and chronic hepatitis C. AIDS. 2013; 6: 27-9.
  18. Bibert S., Roger T., Calandra T., Bochud M., Cerny A. et al. IL28B expression depends on a novel TT/-G polymorphism which improves HCV clearance prediction. J. Exp. Med. 2013; 210: 1109-16.
  19. Nozawa Y., Umemura T., Katsuyama Y., Shibata S., Kimura T. et al. Genetic polymorphism in IFNL4 and response to pegylated interferon-a and ribavirin in Japanese chronic hepatitis C patients. Tissue. Antigens. 2014; 83: 45-8.
  20. Fujino H., Imamura M., Nagaoki Y., Kawakami Y., Abe H. et al Predictive value of the IFNL4 polymorphism on outcome of telaprevir, peginterferon, and ribavirin therapy for older patients with genotype 1b chronic hepatitis C. J. Gastroenterol. 2013.
  21. Ruzibakiev R., Kato H., Ueda R., Yuldasheva N., Hegay T. et al. Risk factors and seroprevalence of hepatitis B virus, hepatitis C virus, and human immunodeficiency virus infection in uzbekistan. Intervirology. 2001; 44: 327-32.
  22. Kurbanov F., Tanaka Y., Avazova D., Khan A., Sugauchi F. et al. Detection of hepatitis C virus natural recombinant RF1_2k/1b strain among intravenous drug users in uzbekistan. Hepatol. Res. 2008; 38: 457-64.
  23. Kurbanov F., Tanaka Y., Sugauchi F., Kato H., Ruzibakiev R. et al. Hepatitis C virus molecular epidemiology in Uzbekistan. J. Med Virol. 2003; 69: 367-75.
  24. Ito K., Higami K., Masaki N., Sugiyama M., Mukaide M. et al. The rs8099917 polymorphism, when determined by a suitable genotyping method, is a better predictor for response to pegylated a 1 lpha interferon/ribavirin therapy in Japanese patients than other single nucleotide polymorphisms associated with interleukin-28B. J. Clin. Microbiol. 2011; 49: 1853-60.
  25. Lindh M., Lagging M., Norkrans G., Hellstrand K. A model explaining the correlations between IL28B-related genotypes, hepatitis C virus genotypes, and viral RNA levels. Gastroenterology. 2010; 139: 1794-6.
  26. Fischer J., Bohm S., Scholz M., Muller T., Witt H. et al. Combined effects of different IL28B gene variants on the outcome of dual combination therapy in chronic HCV type 1 infection. Hepatology. 2012; 55: 1700-10.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© ООО "Эко-вектор", 2014


 


Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».