Особенности этиологии пневмоний, ассоциированных с вирусом SARS-CoV-2, в Приморском крае

Обоснование. Анализ заболеваемости, включая пневмонии, у пациентов с короновирусной инфекцией представляет большой интерес. Изучение микробного пейзажа мокроты и анализ его чувствительности к антибиотикам позволит назначать лечение с учётом присоединения бактериальной и/или грибковой флоры.

Цель исследования — эпидемиологический анализ заболеваемости коронавирусной инфекцией, вызванной SARS-CoV-2, в Приморском крае за 2021–2023 гг., сравнительный анализ этиологической структуры пневмоний у пациентов c COVID-19 и оценка антибиотикорезистентности микрофлоры нижних дыхательных путей.

Методы. Мы провели ретроспективное когортное исследование на основе архивных материалов ГБУЗ «Краевая клиническая больница № 2» (г. Владивосток). В анализ включили 6491 историю болезни пациентов с подтверждённым COVID-19, находившихся на стационарном лечении в период с 2021 по 2023 г. Бактериологический анализ биоматериала проводили с использованием дифференциально-диагностических сред, идентифицировали выделенные патогены с определением антибиотикорезистентности с помощью автоматического бактериологического анализатора BD Phoenix™ M50.

Результаты. Общее число госпитализированных пациентов с коронавирусной инфекцией в Приморском крае и доля пневмоний среди них достигли максимума в 2021 г., с дальнейшим значительным снижением к 2023 г. В 2021 г. пневмонии преимущественно имели вирусную этиологию, и только в трети случаев выявляли микробного возбудителя. В дальнейшем, у пациентов с лабораторно подтверждённым COVID-19 увеличилась частота присоединения бактериальной флоры, а также выросла доля условно-патогенной флоры (Candida, Mycoplasma pneumoniae). К 2023 г. их доля возросла более чем в 6 раз. Выделенные бактерии были этиологически значимыми и относились к группе ESKAPE. В большинстве случаев их детектировали в монокультуре или в сочетании с дрожжевыми грибами. Анализ микробиоты мокроты показал, что до 2022 г. преобладала грамположительная флора, а в 2023 г. её соотношение с грамотрицательной стало равным. Доля метициллин-резистентных Staphylococcus aureus достигла 52,7%, а устойчивых к большинству антибактериальных препаратов — 77,2%. Грамположительные микроорганизмы обладали резистентностью к антибиотикам пенициллинового ряда и фторхинолонам, а грамотрицательные — к цефалоспоринам III поколения, фторхинолонам и карбапенемам.

Заключение. В 2021 г. при пневмониях, ассоциированных с вирусом SARS-CoV-2, в мокроте преобладала грамположительная флора, тогда как к 2023 г. увеличилось количество грамотрицательной и условно-патогенной флоры. Наиболее часто встречающиеся грамположительные микроорганизмы чаще всего проявляли устойчивость к пенициллинам и фторхинолонам, а грамотрицательные — к цефалоспоринам III поколения, фторхинолонам и карбапенемам. Таким образом, микробный пейзаж мокроты при пневмониях у пациентов с COVID-19 в Приморском крае имеет свои особенности, которые необходимо учитывать при назначении антибактериальной терапии.