Связь цитокинов и численности микросимбионтов при микроэкологических нарушениях кишечника человека

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Цитокины и хемокины, кишечные микросимбионты, являясь необходимыми участниками межклеточных коммуникаций в норме, поддерживая гомеостаз слизистой оболочки кишечника, могут быть ключевыми факторами воспаления кишечника и повреждения эпителиального барьера. Данная работа расширяет представления о взаимосвязи микробных сообществ кишечника с локальной цитокиновой сетью хозяина. В работе представлены результаты анализа корреляционных связей таксономического состава кишечных микросимбионтов и уровня про- (TNFα, IFNγ, IL-8) и противовоспалительных цитокинов (IL-10, IL-1ra) в копрофильтратах клинически здоровых людей, обследуемых на дисбиоз. Определение цитокинов в копрофильтратах проводилось ИФА (АО «Вектор-Бест», Россия). Исследование 65 микросимбиоценозов кишечника человека осуществлялось классическим бактериологическим методом. Идентификацию облигатно-анаэробных (Bifidobacterium spp., Bacteroides spp., Cutibacterium acnes, Clostridium spp.) и факультативно-анаэробных бактерий (Escherichia coli, Klebsiellae spp., Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp., Citrobacter freundii, Proteus mirabilis, Streptococcus spp., Staphylococcus spp., Enterococcus faecium) и Candida spp. проводили времяпролетной масс-спектрометрией MALDI TOF MS серии Microflex LT (Bruker Daltoniсs, Германия). Проведенные исследования выявили значимую роль при дисбиозе кишечника ассоциаций энтеробактерий с дрожжевыми грибами и стафилококками. В структуре облигатно-анаэробного звена микробиоты наблюдалась смена консорциумов из нескольких видов бифидобактерий и лактобактерий при эубиозе на моновидовой вариант при дисбиозе. При этом увеличивалось количество ассоциаций, в состав которых входили клостридии. Анализ корреляционных связей показателей цитокинов и численности микробиоты кишечника показал сохранение в условиях дисбиоза установленных при эубиозе значимых связей с увеличением их коэффициента корреляции: Bifidobacterium spp., Enterobacteriaceae, Staphylococcus spp., Candida spp. с TNFα. Вместе с тем при дисбиозе менялась направленность связей и определялись новые корреляционные связи: для Staphylococcus spp. и IFNγ; Staphylococcus spp. и IL-8; Enterobacteriaceae и IL-1ra, IFNγ. Установленные особенности корреляционных связей между показателями микросимбиоценоза и количественными изменениями цитокинов позволяют рассматривать таксономический состав микросимбиоценоза и профиль цитокинов как фактор, который может влиять на состояние гомеостаза кишечника при эу- и дисбиозе.

Об авторах

Таисия Александровна Бондаренко

ФГБУН «Оренбургский федеральный исследовательский центр» УрО РАН

Email: semenovih88@mail.ru

научный сотрудник лаборатории инфекционной симбиологии, Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук

Россия, 460000, Оренбург, ул. Пионерская, 11

Елена Валерьевна Иванова

ФГБУН «Оренбургский федеральный исследовательский центр» УрО РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: walerewna13@gmail.com

д.м.н., доцент, ведущий научный сотрудник лаборатории инфекционной симбиологии, Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук

Россия, 460000, Оренбург, ул. Пионерская, 11

Анастасия Владимировна Бекпергенова

ФГБУН «Оренбургский федеральный исследовательский центр» УрО РАН

Email: nsavasteeva@gmail.com

к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории инфекционной симбиологии, Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук

Россия, 460000, Оренбург, ул. Пионерская, 11

Ирина Николаевна Чайникова

ФГБУН «Оренбургский федеральный исследовательский центр» УрО РАН

Email: inchainicova@yandex.ru

д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории инфекционной симбиологии, Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук

Россия, 460000, Оренбург, ул. Пионерская, 11

Ольга Ефимовна Челпаченко

ФГБУН «Оренбургский федеральный исследовательский центр» УрО РАН

Email: oech57@gmail.com

д.м.н., профессор, ведущий научный сотрудник лаборатории инфекционной симбиологии, Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук

Россия, 460000, Оренбург, ул. Пионерская, 11

Игорь Александрович Никифоров

ФГБУН «Оренбургский федеральный исследовательский центр» УрО РАН

Email: ianikiforov@rambler.ru

к.г.-м.н., ведущий научный сотрудник лаборатории инфекционной симбиологии, Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук

Россия, 460000, Оренбург, ул. Пионерская, 11

Ирина Александровна Здвижкова

ФГБУН «Оренбургский федеральный исследовательский центр» УрО РАН

Email: zdvizhkova.irina@gmail.com

научный сотрудник лаборатории инфекционной симбиологии, Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук

Россия, 460000, Оренбург, ул. Пионерская, 11

Список литературы

  1. Иванова Е.И., Бондаренко Т.А., Чайникова И.Н., Перунова Н.Б. Локальные антимикробные факторы и цитокины при дисбиозе кишечника человека // Российский иммунологический журнал, 2015. Т. 9 (18), № 2 (1). С. 691-692. [Ivanova E.I., Bondarenko T.A., Chaynikova I.N., Perunova N.B. Local antimicrobial factors and cytokines in human intestinal dysbiosis. Rossiyskiy immunologicheskiy zhurnal = Russian Journal of Immunology, 2015, Vol. 9 (18), no. 2 (1), рp. 691-692. (In Russ.)]
  2. Andrews C., McLean M.H., Durum S.K. Cytokine tuning of intestinal epithelial function. Front Immunol., 2018, Vol. 9, 1270. doi: 10.3389/fimmu.2018.01270.
  3. Ciesielska A., Matyjek M., Kwiatkowska K. TLR4 and CD14 trafficking and its influence on LPS-induced pro-inflammatory signaling. Cell. Mol. Life Sci., 2021, Vol. 78, no. 4, pp. 1233-1261.
  4. Hirayama D., Iida T., Nakase H. The phagocytic function of macrophage-enforcing innate immunity and tissue homeostasis. Int. J. Mol. Sci., 2018, Vol. 19, no. 1, 92. doi: 10.3390/ijms19010092.
  5. Hou K., Wu Z.X., Chen X.Y., Wang J.Q., Zhang D., Xiao C., Zhu D., Koya J.B., Wei L., Li J., Chen Z.S. Microbiota in health and diseases. Signal Transduct. Target. Ther., 2022, Vol. 7, no. 1, 135. doi: 10.1038/s41392-022-00974-4.
  6. Jeffery V., Goldson A.J., Dainty J.R., Chieppa M., Sobolewski A. IL-6 signaling regulates small intestinal crypt homeostasis. J. Immunol., 2017, Vol. 199, рр. 304-311.
  7. Jones S.A., Bryant C., Lloyd C.M., McInnes I., O’Neill L. A vision for cytokine biology with 20/20 clarity. Function (Oxf.), 2020, Vol. 2, no. 1, zqaa042. doi: 10.1093/function/zqaa042.
  8. Neurath M.F. Cytokines in inflammatory bowel disease. Nat. Rev. Immunol., 2014, Vol. 14, no. 5, рр. 329-342.
  9. Pascale A., Marchesi N., Marelli C., Coppola A., Luzi L., Govoni S., Giustina A., Gazzaruso C. Microbiota and metabolic diseases. Endocrine, 2018, Vol. 61, рр. 357-371.
  10. Peterson L.W., Artis D. Intestinal epithelial cells: regulators of barrier function and immune homeostasis. Nat. Rev. Immunol., 2014, Vol. 14, no. 3, рр. 141-153.
  11. Sumagin R., Robin A.Z., Nusrat A., Parkos C.A. Transmigrated neutrophils in the intestinal lumen engage ICAM-1 to regulate the epithelial barrier and neutrophil recruitment. Mucosal Immunol., 2014, Vol. 7, no. 4, рр. 905-915.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рисунок 1. Коэффициент (r) корреляционных связей показателей локального уровня цитокинов в копрофильтратах и численности микросимбионтов при эубиозе (А) и дисбиозе (Б) толстого кишечника человека

Скачать (397KB)

© Бондаренко Т.А., Иванова Е.В., Бекпергенова А.В., Чайникова И.Н., Челпаченко О.Е., Никифоров И.А., Здвижкова И.А., 2022

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».