Вирус Эпштейна–Барр (Herpesviridae: Gammaherpesvirinae: Lymphocryptovirus: Human gammaherpesvirus 4)у калмыков и славян, проживающих на территории России: типы вируса, варианты онкогена LMP1 и злокачественные опухоли

Обложка
  • Авторы: Гурцевич В.Э.1, Лубенская А.К.1, Сенюта Н.Б.2, Душенькина Т.Е.2, Смирнова К.В.3,4
  • Учреждения:
    1. НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России
    2. НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава
    3. НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России, 115478
    4. ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова (РНИМУ)» Минздрава России
  • Выпуск: Том 67, № 3 (2022)
  • Страницы: 246-257
  • Раздел: ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
  • URL: https://ogarev-online.ru/0507-4088/article/view/118238
  • DOI: https://doi.org/10.36233/0507-4088-120
  • ID: 118238

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Введение. Открытие типов вируса Эпштейна–Барр (Herpesviridae: Gammaherpesvirinae: Lymphocryptovirus: Human gammaherpesvirus 4) (ВЭБ) – ВЭБ-1 и ВЭБ-2, обладающих различной трансформирующей способностью in vitro, стимулировало изучение их распространённости в популяциях с целью выяснения связи со злокачественными новообразованиями.

Цели работы – изучение распространённости ВЭБ-1 и ВЭБ-2 у представителей 2 этносов России, калмыков и славян, сиквенсный анализ онкогена LMP1 в изолятах вируса и анализ корреляции между типами вируса и заболеваемостью определенными формами опухолей.

Материалы и методы. Из биологического материала смывов полости рта, полученных от этнических калмыков Республики Калмыкия (РК) (n = 50) и славян, жителей Московской области (МО) (n = 40), выделяли образцы ДНК. Последние использовали для амплификации ДНК ВЭБ, с последующим определением её концентрации на 1 клетку смыва, амплификацией в вирусных образцах онкогена LMP1, их секвенированием и определением белковых вариантов LMP1.

Результаты. Установлено, что при одинаковой нагрузке ВЭБ среди представителей обоих этносов в группе калмыков соотношение лиц, инфицированных трансформирующим и нетрансформирующим типами вируса, было практически одинаковым (ВЭБ-1 – 51%; и ВЭБ-2 – 49%), а в группе славян доминировал трансформирующий тип ВЭБ-1 (80,6%). Доминантное инфицирование представителей славян 1-м типом вируса (ВЭБ-1) коррелировало с повышенными показателями заболеваемости некоторыми формами опухолей у населения МО при сравнении с аналогичными показателями у населения РК, представители которой инфицированы обоими типами вируса. Различия между сравниваемыми показателями онкозаболеваемости не были статистически значимыми. Анализ вирусных изолятов показал близкий набор вариантов LMP1 у обеих этнических групп.

Заключение. С целью установления влияния типов ВЭБ на заболеваемость злокачественными новообразованиями необходимы дополнительные исследования с участием представителей различных этнических групп из разных географических регионов.

Об авторах

Владимир Эдуардович Гурцевич

НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России

Email: gurtsevitch-vlad-88@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0003-1840-4364

д.м.н., профессор, главный научный консультант лаборатории вирусного канцерогенеза

Россия, 115478, Москва, Каширское шоссе 24

Александра Кирилловна Лубенская

НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России

Email: lubenskaya.96@mail.ru
ORCID iD: 0000-0003-3953-7449

научный сотрудник лаборатории вирусного канцерогенеза

Россия, 115478, Москва, Каширское шоссе 24

Наталья Борисовна Сенюта

НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава

Email: nat.senyuta@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-8915-8274

к.м.н., научный консультант лаборатории вирусного канцерогенеза

Россия, 115478, Москва, Каширское шоссе 24

Татьяна Егоровна Душенькина

НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава

Email: tatyana.dushenkina@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-8279-514X

лаборант-исследователь лаборатории вирусного канцерогенеза

Россия, 115478, Москва, Каширское шоссе 24

Ксения Валерьевна Смирнова

НИИ канцерогенеза ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии им. Н.Н. Блохина» Минздрава России, 115478; ФГАОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова (РНИМУ)» Минздрава России

Автор, ответственный за переписку.
Email: skv.lab@yandex.ru
ORCID iD: 0000-0001-6209-977X

к.б.н., заведующая лабораторией вирусного канцерогенеза

Россия, 115478, Москва, Каширское шоссе 24; 117997, Москва

Список литературы

  1. Davison A.J., Eberle R., Ehlers B., Hayward G.S., McGeoch D.J., Minson A.C., et al. The order Herpesvirales. Arch. Virol. 2009; 154(1): 171–7. https://doi.org/10.1007/s00705-008-0278-4
  2. Dolan A., Addison C., Gatherer D., Davison A.J., McGeoch D.J. The genome of Epstein–Barr virus type 2 strain AG876. Virology. 2006; 350(1): 164–70. https://doi.org/10.1016/j.virol.2006.01.015
  3. Young L.S., Rickinson A.B. Epstein–Barr virus: 40 years on. Nat. Rev. Cancer. 2004; 4(10): 757–68. https://doi.org/10.1038/nrc1452
  4. Moore P.S., Chang Y. Why do viruses cause cancer? Highlights of the first century of human tumour virology. Nat. Rev. Cancer. 2010; 10(12): 878–89. https://doi.org/10.1038/nrc2961
  5. McGeoch D.J. Molecular evolution of the γ–Herpesvirinae. Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 2001; 356(1408): 421–35. https://doi.org/10.1098/rstb.2000.0775
  6. Sample J., Young L., Martin B., Chatman T., Kieff E., Rickinson A., et al. Epstein–Barr virus types 1 and 2 differ in their EBNA-3A, EBNA-3B, and EBNA-3C genes. J. Virol. 1990; 64(9): 4084–92. https://doi.org/10.1128/JVI.64.9.4084-4092.1990
  7. Gratama J.W., Ernberg I. Molecular epidemiology of Epstein–Barr virus infection. Adv. Cancer Res. 1995; 67: 197–255.
  8. Coleman C.B., Wohlford E.M., Smith N.A., King C.A., Ritchie J.A., Baresel P.C., et al. Epstein–Barr virus type 2 latently infects T cells, inducing an atypical activation characterized by expression of lymphotactic cytokines. J. Virol. 2015; 89(4): 2301–12. https://doi.org/10.1128/JVI.03001-14
  9. Kaymaz Y., Oduor C.I., Yu H., Otieno J.A., Ong’echa J.M., Moormann A.M., et al. Comprehensive transcriptome and mutational profiling of endemic Burkitt lymphoma reveals EBV type-specific differences. Mol. Cancer Res. 2017; 15(5): 563–76. https://doi.org/10.1158/1541-7786.MCR-16-0305
  10. Bentz G.L., Whitehurst C.B., Pagano J.S. Epstein–Barr virus latent membrane protein 1 (LMP1) C-terminal-activating region 3 contributes to LMP1-mediated cellular migration via its interaction with Ubc9. J. Virol. 2011; 85(19): 10144–53. https://doi.org/10.1128/JVI.05035-11
  11. Li H.P., Chang Y.S. Epstein–Barr virus latent membrane protein 1: structure and functions. J. Biomed. Sci. 2003; 10(5): 490–504. https://doi.org/10.1007/BF02256110
  12. Dawson C.W., Port R.J., Young L.S. The role of the EBV-encoded latent membrane proteins LMP1 and LMP2 in the pathogenesis of nasopharyngeal carcinoma (NPC). Semin. Cancer Biol. 2012; 22(2): 144–53. https://doi.org/10.1016/j.semcancer.2012.01.004
  13. Edwards R.H., Seillier-Moiseiwitsch F., Raab-Traub N. Signature amino acid changes in latent membrane protein 1 distinguish Epstein–Barr virus strains. Virology. 1999; 261(1): 79–95. https://doi.org/10.1006/viro.1999.9855
  14. Saechan V., Settheetham-Ishida W., Kimura R., Tiwawech D., Mitarnun W., Ishida T. Epstein–Barr virus strains defined by the latent membrane protein 1 sequence characterize Thai ethnic groups. J. Gen. Virol. 2010; 91(Pt. 8): 2054–61. https://doi.org/10.1099/vir.0.021105-0
  15. Saechan V., Mori A., Mitarnun W., Settheetham-Ishida W., Ishida T. Analysis of LMP1 variants of EBV in Southern Thailand: evidence for strain-associated T-cell tropism and pathogenicity. J. Clin. Virol. 2006; 36(2): 119–25. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2006.01.018
  16. Gantuz M., Lorenzetti M.A., Chabay P.A., Preciado M.V. A novel recombinant variant of latent membrane protein 1 from Epstein Barr virus in Argentina denotes phylogeographical association. PLoS One. 2017; 12(3): e0174221. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0174221
  17. Burrows J.M., Bromham L., Woolfit M., Piganeau G., Tellam J., Connolly G., et al. Selection pressure-driven evolution of the Epstein–Barr virus-encoded oncogene LMP1 in virus isolates from Southeast Asia. J. Virol. 2004; 78(13): 7131–7. https://doi.org/10.1128/JVI.78.13.7131-7137.2004
  18. Lin H.J., Cherng J.M., Hung M.S., Sayion Y., Lin J.C. Functional assays of HLA A2-restricted epitope variant of latent membrane protein 1 (LMP-1) of Epstein–Barr virus in nasopharyngeal carcinoma of Southern China and Taiwan. J. Biomed. Sci. 2005; 12(6): 925–36. https://doi.org/10.1007/s11373-005-9017-y
  19. Smirnova K.V., Senyuta N.B., Botezatu I.V., Dushenkina T.E., Lubenskaya A.K., Frolovskaya A.A., et al. Epstein–Barr virus in the ethnic Tatars population: the infection and sequence variants of LMP1 oncogene. Успехи молекулярной онкологии. 2018; 5(3): 65–74. https://doi.org/10.17650/2313-805X-2018-5-3-65-74.
  20. Hahn P., Novikova E., Scherback L., Janik C., Pavlish O., Arkhipov V., et al. The LMP1 gene isolated from Russian nasopharyngeal carcinoma has no 30-bp deletion. Int. J. Cancer. 2001; 91(6): 815–21. https://doi.org/10.1002/1097-0215(200002)9999:9999<::aid-ijc1122>3.0.co;2-w
  21. Salahuddin S., Khan J., Azhar J., Khan J., Muhammad N. Prevalence of Epstein–Barr virus genotypes in Pakistani lymphoma patients. Asian Pac. J. Cancer Prev. 2018; 19: 3153–9. https://doi.org/10.31557/APJCP.2018.19.11.3153
  22. Lo Y.M., Chan L.Y., Chan A.T., Leung S.F., Lo K.W., Zhang J. Quantitative and temporal correlation between circulating cell-free Epstein–Barr virus DNA and tumor recurrence in nasopharyngeal carcinoma. Cancer Res. 1999; 59(21): 5452–5.
  23. Lawrence J.B., Villnave C.A., Singer R.H. Sensitive, high-resolution chromatin and chromosome mapping in situ: presence and orientation of two closely integrated copies of EBV in a lymphoma line. Cell. 1988; 52(1): 51–61. https://doi.org/10.1016/0092-8674(88)90530-2
  24. Botezatu I.V., Kondratova V.N., Shelepov V.P., Lichtenstein A.V. DNA melting analysis: application of the “open tube” format for detection of mutant KRAS. Anal. Biochem. 2011; 419(2): 302–8. https://doi.org/10.1016/j.ab.2011.08.015
  25. Смирнова К.В., Дидук С.В., Сенюта Н.Б., Гурцевич В.Э. Молекулярно-биологические свойства гена LMP1 вируса Эпштейна–Барр: структура, функции и полиморфизм. Вопросы вирусологии. 2015; 60(3): 5–13.
  26. Scheinfeld A.G., Nador R.G., Cesarman E., Chadburn A., Knowles D.M. Epstein–Barr virus latent membrane protein-1 oncogene deletion in post-transplantation lymphoproliferative disorders. Am. J. Pathol. 1997; 151(3): 805–12.
  27. Miller W.E., Edwards R.H., Walling D.M., Raab-Traub N. Sequence variation in the Epstein–Barr virus latent membrane protein 1. J. Gen. Virol. 1994; 75(Pt. 10): 2729–40. https://doi.org/10.1099/0022-1317-75-10-2729
  28. Kanai K., Satoh Y., Saiki Y., Ohtani H., Sairenji T. Difference of Epstein–Barr virus isolates from Japanese patients and African Burkitt’s lymphoma cell lines based on the sequence of latent membrane protein 1. Virus Genes. 2007; 34(1): 55–61. https://doi.org/10.1007/s11262-006-0010-y
  29. Senyuta N., Yakovleva L., Goncharova E., Scherback L., Diduk S., Smirnova K., et al. Epstein–barr virus latent membrane protein 1 polymorphism in nasopharyngeal carcinoma and other oral cavity tumors in Russia. J. Med. Virol. 2014; 86(2): 290–300. https://doi.org/10.1002/jmv.23729
  30. Schuster V., Ott G., Seidenspinner S., Kreth H.W. Common Epstein–Barr virus (EBV) type-1 variant strains in both malignant and benign EBV-associated disorders. Blood. 1996; 87(4): 1579–85.
  31. Khanim F., Yao Q.Y., Niedobitek G., Sihota S., Rickinson A.B., Young L.S. Analysis of Epstein–Barr virus gene polymorphisms in normal donors and in virus-associated tumors from different geographic locations. Blood. 1996; 88(9): 3491–501.
  32. Лубенская А.К., Сенюта Н.Б., Ботезату И.В., Душенькина Т.Е., Лихтенштейн А.В., Гурцевич В.Э., Смирнова К.В. Вирус Эпштейна–Барр у адыгейцев и славян в России: типы вируса, варианты LMP1 и злокачественные новообразования. Материалы VI Всероссийской конференции по молекулярной онкологии, 21–23 декабря 2021 г., Москва. Успехи молекулярной онкологии. 2021; 4(8): 96–97.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Типы вируса Эпштейна–Барр и концентрация ДНК в 1 мл смыва полости рта: а – в группе калмыков; б – в группе славян.

Скачать (285KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Варианты повторов участков из 11 аминокислот в С-концевом домене изолятов гена LMP1 вируса Эпштейна–Барр в группе этнических калмыков (Республика Калмыкия).

Скачать (379KB)
Метаданные
4. Рис. 3. Заболеваемость злокачественными опухолями, частично ассоциированными с вирусом Эпштейна–Барр, у населения Республики Калмыкия и Московской области в 2019 г.

Скачать (84KB)
Метаданные
5. Дополнительные материалы к статье Гурцевич В.Э.
Скачать (569KB)
Метаданные

© Гурцевич В.Э., Лубенская А.К., Сенюта Н.Б., Душенькина Т.Е., Смирнова К.В., 2022

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».