Biological Microarray for Detection of Somatic Mutations in the Genes of Isocitrate Dehydrogenase 1 and 2

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

Mutations in isocitrate dehydrogenases 1 and 2 (IDH1 and IDH2) genes are important diagnostic and prognostic markers in a number of tumors (chondroid tumors, brain tumors, leukemia). To determine mutations in the IDH1/2 genes the method of allele-specific hybridization on a biological microarray was developed, which makes it possible to determine the presence of a mutation in a tumor sample (chondroid tumors and glioblastoma) and the variant of nucleotide substitution. When comparing IDH1/2 mutation detection methods using a biological microarray and DNA melting analysis with a TaqMan probe, full coincidence of results was obtained, with the biochip method making it possible to determine the type of nucleotide substitution without an additional sequencing step.

作者简介

V. Varachev

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Email: tanased06@rambler.ru
Russia, 119991, Moscow, ul. Vavilova 32

D. Guskov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Email: tanased06@rambler.ru
Russia, 119991, Moscow, ul. Vavilova 32

A. Shekhtman

Russian Children’s Clinical Hospital

Email: tanased06@rambler.ru
Russia, 119117, Moscow, Leninsky prosp. 117

D. Rogozhin

Russian Children’s Clinical Hospital

Email: tanased06@rambler.ru
Russia, 119117, Moscow, Leninsky prosp. 117

S. Polyakov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Email: tanased06@rambler.ru
Russia, 119991, Moscow, ul. Vavilova 32

A. Chudinov

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Email: tanased06@rambler.ru
Russia, 119991, Moscow, ul. Vavilova 32

A. Zasedatelev

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Email: tanased06@rambler.ru
Russia, 119991, Moscow, ul. Vavilova 32

T. Nasedkina

Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences

Email: tanased06@rambler.ru
Russia, 119991, Moscow, ul. Vavilova 32

参考

  1. Dang L., White D.W., Gross S., Bennett B.D., Bittinger M.A., Driggers E.M., Fantin V.R., Jang H.G., Jin S., Keenan M.C., Marks K.M., Prins R.M., Ward P.S., Yen K.E., Liau L.M., Rabinowitz J.D., Cantley L.C., Thompson C.B., Vander Heiden M.G., Su S.M. // Nature. 2009. V. 462. P. 739–744. https://doi.org/10.1038/nature08617
  2. Cairns R.A., Mak T.W. // Cancer Discov. 2013. V. 3. P. 730–741. https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-13-0083
  3. Chen S., Fritchie K., Wei S., Ali N., Curless K., Shen T., Brini A.T., Latif F., Sumathi V., Siegal G.P., Cheng L. // Hum. Pathol. 2017. V. 65. P. 239–246. https://doi.org/10.1016/j.humpath.2017.05.015
  4. Hartmann C., Meyer J., Balss J., Capper D., Mueller W., Christians A., Felsberg J., Wolter M., Mawrin C., Wick W., Weller M., Herold-Mende C., Unterberg A., Jeuken J.W., Wesseling P., Reifenberger G., von Deimling A. // Acta Neuropathol. 2009. V. 118. P. 469–474. https://doi.org/10.1007/s00401-009-0561-9
  5. Agarwal S., Sharma M.C., Jha P., Pathak P., Suri V., Sarkar C., Chosdol K., Suri A., Kale S.S., Mahapatra A.K., Jha P. // Neuro Oncol. 2013. V. 15. P. 718–726. https://doi.org/10.1093/neuonc/not015
  6. Arita H., Narita Y., Matsushita Y., Fukushima S., Yoshida A., Takami H., Miyakita Y., Ohno M., Shibui S., Ichimura K. // Brain Tumor Pathol. 2015. V. 32. P. 22–30. https://doi.org/10.1007/s10014-014-0186-0
  7. Perizzolo M., Winkfein B., Hui S., Krulicki W., Chan J.A., Demetrick D.J. // Brain Pathol. 2012. V. 22. P. 619–624. https://doi.org/10.1111/j.1750- 3639.2012.00579.x
  8. Табаков Д.В., Катаргин А.Н., Строганова А.М., Сендерович А.И., Насхлеташвили Д.Р., Киселева Н.П. // Усп. мол. онкол. 2017. Т. 4. С. 53–59. https://doi.org/10.17650/2313-805X-2017-4-1-53-59
  9. Emelyanova M., Arkhipova K., Mazurenko N., Chudinov A., Demidova I., Zborovskaya I., Lyubchenko L., Zasedatelev A., Nasedkina T. // Appl. Immunohistochem. Mol. Morphol. 2015. V. 23. P. 255–265. https://doi.org/10.1097/PAI.0000000000000084
  10. Emelyanova M., Ghukasyan L., Abramov I., Ryabaya O., Stepanova E., Kudryavtseva A., Sadritdinova A., Dzhumakova C., Belysheva T., Surzhikov S., Lyubchenko L., Zasedatelev A., Nasedkina T. // Oncotarget. 2017. V. 8. P. 52304–52320. https://doi.org/10.18632/oncotarget.17014
  11. Lee D., Suh Y.L., Kang S.Y., Park T.I., Jeong J.Y., Kim S.H. // Brain Pathol. 2013. V. 23. P. 285–293. https://doi.org/10.1111/bpa.12000
  12. Emelyanova M.A., Telysheva E.N., Orlova K.V., Ryabaya O.O., Snigiryova G.P., Abramov I.S., Mikhailovich V.M. // Cancer Genet. 2021. V. 250–251. P. 25–35. https://doi.org/10.1016/j.cancergen.2020.11.005
  13. Gryadunov D.A., Shaskolskiy B.L., Nasedkina T.V., Rubina A.Y., Zasedatelev A.S. // Acta Naturae. 2018. V. 10. P. 4–18. https://doi.org/10.32607/20758251-2018-10-4-4-18

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
2.

下载 (100KB)
3.

下载 (422KB)
4.

下载 (1MB)

版权所有 © В.О. Варачев, Д.А. Гуськов, А.П. Шехтман, Д.В. Рогожин, С.А. Поляков, А.В. Чудинов, А.С. Заседателев, Т.В. Наседкина, 2023

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».