Влияние пептидных линкеров на функциональные свойства гибридных структур c избирательным рh-зависимым связыванием с раковыми клетками

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Большинство современных методов терапии рака неспецифичны и оказывают побочное вредное воздействие на организм. В настоящее время разрабатываются методы нацеленной терапии рака, в частности с применением адресных пептидов, избирательно связывающихся с раковыми клетками. Цель настоящей работы – изучение перспектив применения пептида pHLIP, связывающегося с раковыми клетками при пониженном рН, в составе рекомбинантных белково-пептидных конструкций для диагностики и адресной терапии рака. Получены гибридные структуры на основе флуоресцентного белка EGFP и линкерной последовательности, соединяющей флуоресцентный белок с двумя различными вариантами pHLIP. Изучено влияние различных линкеров на рН-зависимое связывание конструкций с клетками, а также на эффективность синтеза хромофора EGFP в составе гибридной конструкции.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

А. Ю. Фролова

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: anastasiya_frolova_box@mail.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

А. А. Пахомов

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: anastasiya_frolova_box@mail.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

С. М. Деев

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: anastasiya_frolova_box@mail.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

В. И. Мартынов

ФГБУН “Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова” РАН

Email: anastasiya_frolova_box@mail.ru
Россия, 117997 Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

Список литературы

  1. Reshetnyak Y.K., Andreev O.A., Lehnert U., Engelman D.M. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006. V. 103. P. 6460–6465. https://doi.org/10.1073/pnas.0601463103
  2. Svoronos A.A., Bahal R., Pereira M.C. Barrera F.N., Deacon J.C., Bosenberg M., DiMaio D., Glazer P.M., Engelman D.M. // Mol. Pharm. 2020. V. 17. P. 461– 471. https://doi.org/10.1021/acs.molpharmaceut.9b00883
  3. Frolova A.Yu., Pakhomov A.A., Kakuev D.L., Sungurova A.S., Deyev S.M., Martynov V.I. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2022. V. 612. P. 141–146. https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2022.04.112
  4. Adochite R.-C., Moshnikova A., Golijanin J., Andreev O.A., Katenka N.V., Reshetnyak Y.K. // Mol. Imaging Biol. 2016. V. 18. P. 686–696. https://doi.org/10.1007/s11307-016-0949-6
  5. Reshetnyak Y.K., Moshnikova A., Andreev O.A., Engelman D.M. // Front Bioeng. Biotechnol. 2020. V. 8. P. 335. https://doi.org/10.3389/fbioe.2020.00335
  6. Dharmaratne N.U., Kaplan A.R., Glazer P.M. // Cells. 2021. V. 10. P. 10030541. https://doi.org/10.3390/cells10030541
  7. Liu Y.-C., Wang Z.-X., Pan J.-Y., Wang L.-Q., Dai X.-Y., Wu K.-F., Ye X.-W., Xu X.-L. // Molecules. 2023. V. 28. P. 2175. https://doi.org/10.3390/molecules28052175
  8. Frolova A.Yu, Pakhomov A.A., Kakuev D.L., Sungurova A.S., Dremina A.A., Mamontova E.D., Deyev S.M., Martynov V.I. // J. Photochem. Photobiol. B Biol. 2023. V. 249. P. 112803. https://doi.org/10.1016/j.jphotobiol.2023.112803
  9. Weerakkody D., Moshnikova A., Thakur M.S., Moshnikova V., Daniels J., Engelman D.M., Andreev O.A., Reshetnyak Y.K. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2013. V. 110. P. 5834–5839. https://doi.org/10.1073/pnas.1303708110
  10. Pakhomov A.A., Frolova A.Yu., Tabakmakher V.M., Chugunov A.O., Efremov R.G., Martynov V.I. // J. Photochem. Photobiol. B Biol. 2020. V. 206. P. 111853. https://doi.org/10.1016/j.jphotobiol.2020.111853
  11. McRae S.R., Brown C.L., Bushell G.L. // Protein Expr. Purif. 2005. V. 41. P. 121–127. https://doi.org/10.1016/j.pep.2004.12.030

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать
2. Рис. 1. Упрощенная схема (а) и пространственная модель (б) гибридных конструкций. Гексагистидиновая метка обозначена синим цветом, флуоресцентный белок – зеленым, линкер (linker) – лиловым, pHLIP – оранжевым.

Скачать (137KB)
Метаданные
3. Рис. 2. Нормализованные спектры поглощения конструкций EGFP/pHLIP и EGFP.

Скачать (117KB)
Метаданные
4. Рис. 3. рН-зависимое связывание с клетками HeLa конструкций EGFP/pHLIPwt и EGFP/pHLIPvar3 с линкерами GS и IEGRCGS при различных значениях рН. Значения медиан интенсивности флуоресценции (MFI) нормированы относительно EGFP-IEGFCGS-pHLIPwt (наиболее эффективно связывающейся конструкции) с поправкой на степень созревания хромофора.

Скачать (131KB)
Метаданные
5. Рис. 4. pH-зависимое связывание EGFP/pHLIPwt с клетками HeLa, определенное с помощью конфокальной микроскопии. Слева направо: изображения в зеленом (EGFP, возбуждение 488 нм, излучение 500–550 нм) и синем (Hoechst 33258, возбуждение 405 нм, излучение 420–470 нм) каналах флуоресценции, проходящем свете и их наложение. Масштабный отрезок 20 мкм.

Скачать (471KB)
Метаданные
6. ПРИЛОЖЕНИЕ Рис. S1
Скачать (248KB)
Метаданные

© Российская академия наук, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».