Genetic Identification of Microsymbionts of the Legume Hedysarum arcticum B. Fedtsch, Growing on Samoylovsky Island in the Lena River Delta (Arctic Zone of Yakutia)

封面

如何引用文章

全文:

开放存取 开放存取
受限制的访问 ##reader.subscriptionAccessGranted##
受限制的访问 订阅存取

详细

Bacterial strains isolated from root nodules of the legume plant Hedysarum arcticum B. Fedtsch growing on Samoylovsky Island in the Lena River delta (Arctic zone of Yakutia) were assigned to the genera Rhizobium (family Rhizobiaceae) and Mesorhizobium (Phyllobacteriaceae) of the order Hyphomicrobiales (class Alphaproteobacteria) according to the rrs gene sequencing data. According to phylogenetic analysis of concatemers of the atpD, dnaK, gyrB, and rpoB genes, the strains belonged to the species Rhizobium giardinii and Mesorhizobium norvegicum. The strains were shown to be facultative psychrotrophs growing at 5 and 28ºC. These microsymbionts are promising for further study of their symbiotic efficiency regarding other forage legume species, with an aim to establish highly productive agrophytocenoses in the Far North.

全文:

受限制的访问

作者简介

D. Karlov

All-Russia Research Institute for Agricultural Microbiology

编辑信件的主要联系方式.
Email: ds.karlov@arriam.ru
俄罗斯联邦, Saint Petersburg

P. Guro

All-Russia Research Institute for Agricultural Microbiology

Email: ds.karlov@arriam.ru
俄罗斯联邦, Saint Petersburg

I. Kuznetsova

All-Russia Research Institute for Agricultural Microbiology

Email: ds.karlov@arriam.ru
俄罗斯联邦, Saint Petersburg

А. Sazanova

All-Russia Research Institute for Agricultural Microbiology

Email: ds.karlov@arriam.ru
俄罗斯联邦, Saint Petersburg

I. Alekhina

Arctic and Antarctic Research Institute

Email: ds.karlov@arriam.ru
俄罗斯联邦, Saint Petersburg

N. Tikhomirova

All-Russia Research Institute for Agricultural Microbiology

Email: ds.karlov@arriam.ru
俄罗斯联邦, Saint Petersburg

N. Lashchinsky

Central Siberian Botanical Garden, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences

Email: ds.karlov@arriam.ru
俄罗斯联邦, Novosibirsk

А. Belimov

All-Russia Research Institute for Agricultural Microbiology

Email: ds.karlov@arriam.ru
俄罗斯联邦, Saint Petersburg

V. Safronova

All-Russia Research Institute for Agricultural Microbiology

Email: ds.karlov@arriam.ru
俄罗斯联邦, Saint Petersburg

参考

  1. Котелина Н. С., Арчегова И. Б., Романов Г. Г., Турубанова Л. П. Особенности природопользования и перспективы природовосстановления на Крайнем Севере России. Екатеринбург: УрО РАН, 1998. 148 с.
  2. Стратегия развития Арктической зоны Российской Федерации и обеспечения национальной безопасности на период до 2035 года. Утверждена Указом Президента РФ № 645 от 26 октября 2020 г. URL: http://kremlin.ru/acts/news/64274
  3. Экологические основы управления продуктивностью агрофитоценозов восточноевропейской тундры / Под ред. Арчегова И. Б., Котелина Н. С., Грунина Л.К и др. Л.: Наука, 1991. 152 с.
  4. Amarger N., Macheret V., Laguerre G. Rhizobium gallicum sp. nov. and Rhizobium giardinii sp. nov., from Phaseolus vulgaris nodules // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. V. 47. P. 996–1006. https://doi.org/10.1099/00207713-47-4-996
  5. Andrews M., Andrews M. E. Specificity in legume-rhizobia symbiosis // Int. J. Mol. Sci. 2017. V. 18. Art. 705. https://doi.org/10.3390/ijms18040705
  6. Helene L. C. F., Dall’Agnol R. F., Delamuta J. R. M., Hungria M. Mesorhizobium atlanticum sp. nov., a new nitrogen-fixing species from soils of the Brazilian Atlantic Forest biome // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2019. V. 69. P. 1800–1806. https://doi.org/10.1099/ijsem.0.003397
  7. Jarvis B. D.W., Pankhurst C. E., Patel J. J. Rhizobium loti, a new species of legume root nodule bacteria // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 1982. V. 32. P. 378–380. https://doi.org/10.1099/00207713-32-3-378
  8. Kabdullayeva T., Crosbie D. B., Marín M. Mesorhizobium norvegicum sp. nov., a rhizobium isolated from a Lotus corniculatus root nodule in Norway // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2020. V. 70. P. 388–396. https://doi.org/10.1099/ijsem.0.003769
  9. Kumar S., Stecher G., Li M., Knyaz C., Tamura K. MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms // Mol. Biol. Evol. 2018. V. 35. P. 1547–1549. https://doi.org/10.1093/molbev/msy096
  10. Martens M., Delaere M., Coopman R., De Vos P., Gillis M., Willems A. Multilocus sequence analysis of Ensifer and related taxa // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2007. V. 57. P. 489–503. https://doi.org/10.1099/ijs.0.64344-0
  11. Novikova N., Safronova V. Transconjugants of Agrobacterium radiobacter harbouring sym genes of Rhizobium galegae can form an effective symbiosis with Medicago sativa // FEMS Microbiol. Lett. 1992. V. 93. P. 261–268. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.1992.tb05107.x
  12. Safronova V. I., Kuznetsova I. G., Sazanova A. L. et al. Microvirga ossetica sp. nov., a species of rhizobia isolated from root nodules of the legume species Vicia alpestris Steven // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2017. V. 67. P. 94–100. https://doi.org/10.1099/ijsem.0.001577
  13. Weir B. S., Turner S. J., Silvester W. D., Park D.-C., Young J. M. Mesorhizobium strains and Rhizobium leguminosarum nodulate native legume genera of New Zealand, while introduced legume weeds asre nodulated by Bradyrhizobium species // Appl. Environ. Microbiol. 2004. V. 70. P. 5980–5987. https://doi.org/10.1128/AEM.70.10.5980-5987.2004
  14. Zhao C. T., Wang E. T., Chen W. F., Chen W. X. Diverse genomic species and evidences of symbiotic gene lateral transfer detected among the rhizobia associated with Astragalus species grown in the temperate regions of China // FEMS Microbiol. Lett. 2008. V. 286. P. 263–273. https://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2008.01282.x

补充文件

附件文件
动作
1. JATS XML
下载
2. Fig. 1. Phylogenetic tree of the Rhizobium genus using 16S rRNA gene sequences. Figures (%) in the branching nodes - reliability by bootstrap analysis of 500 alternative trees

下载 (206KB)
索引源数据
3. Fig. 2. Phylogenetic tree of Rhizobium representatives based on concatemers of rpoB, atpD and dnaK genes. Figures (%) in the branching nodes - reliability by bootstrap analysis of 500 alternative trees

下载 (141KB)
索引源数据
4. Fig. 3. Phylogenetic tree of representatives of the genus Mesorhizobium constructed using 16S rRNA gene sequences. Figures (%) in the branching nodes - reliability by bootstrap analysis of 500 alternative trees

下载 (220KB)
索引源数据
5. Fig. 4. Phylogenetic tree of Mesorhizobium genus representatives based on concatemers of rpoB, gyrB, atpD and dnaK genes. Figures (%) in branching nodes - reliability by bootstrap analysis of 500 alternative trees

下载 (140KB)
索引源数据

版权所有 © Russian Academy of Sciences, 2024

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».