Полиморфизм локуса rs1421085 гена FTO в популяциях человека: геногеографический аспект

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Изменчивость гена FTO привлекает широкое внимание генетиков и медиков в связи с выявленными в популяциях человека ассоциациями вариантов полиморфизма этого гена с весом тела и ожирением, что, в свою очередь, приводит к широкому спектру заболеваний. Одним из наиболее изученных полиморфных локусов гена FTO является rs1421085. Замена T→C в этом локусе приводит к появлению аллеля rs1421085-C, который повышает риск развития патологий, обусловленных ожирением. Исследования бурой жировой ткани человека показали, что носители аллеля rs1421085-C характеризуются более высоким уровнем экспрессии термогенных генов и термогенеза в целом в сравнении с T-носителями. Это стало основой гипотезы о том, что особенности географического распределения варианта rs1421085-С в популяциях отражают процессы адаптации человека к холоду, особенно в северных регионах планеты. Для проверки этой гипотезы нами изучено распределение полиморфных вариантов локуса rs1421085 у современного и древнего населения Сибири и в других регионах мира. Обнаружено, что и в современных, и в древних популяциях Сибири частота варианта rs1421085-С не увеличивается в северном направлении, максимальна в популяциях Ближнего Востока и Европы. Вполне вероятно, что этот вариант полиморфизма гена FTO мог быть мишенью для естественного отбора лишь на самых ранних этапах адаптации древних людей к холоду на территории Западной Евразии.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Б. А. Малярчук

Институт биологических проблем Севера Дальневосточного отделения Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: malbor@mail.ru
Россия, Магадан

А. Н. Литвинов

Институт биологических проблем Севера Дальневосточного отделения Российской академии наук

Email: malbor@mail.ru
Россия, Магадан

Список литературы

  1. Dina C., Meyre D., Gallina S. et al. Variation in FTO contributes to childhood obesity and severe adult obesity // Nat. Genet. 2007. V. 39. P. 724–726. https://doi.org/10.1038/ng2048
  2. Meyre D., Delplanque J., Chèvre J.C. et al. Genome-wide association study for early-onset and morbid adult obesity identifies three new risk loci in European populations // Nat. Genet. 2009. V. 41. P. 157–159. https://doi.org/10.1038/ng.301
  3. Loos R.J., Yeo G.S. The bigger picture of FTO: The first GWAS-identified obesity gene // Nat. Rev. Endocrinol. 2014. V. 10. P. 51–61. https://doi.org/10.1038/nrendo.2013.227
  4. Yin D., Li Y., Liao X. et al. FTO: А critical role in obesity and obesity-related diseases // Br. J. Nutr. 2023. V. 130. P. 1657–1664. https://doi.org/10.1017/S0007114523000764
  5. Кучер А.Н. Ген FTO и болезни: значимость генетического полиморфизма, эпигенетических модификаций и средовых факторов // Генетика. 2020. Т. 56. № 9. С. 985–1005. https://doi.org/10.31857/S0016675820090131
  6. Price R.A., Li W.D., Zhao H. FTO gene SNPs associated with extreme obesity in cases, controls and extremely discordant sister pairs // BMC Med. Genet. 2008. V. 9. P. 4. https://doi.org/10.1186/1471-2350-9-4
  7. Claussnitzer M., Dankel S.N., Kim K.H. et al. FTO obesity variant circuitry and adipocyte browning in humans // N. Eng. J. Med. 2015. V. 373. P. 895–907. https://doi.org/10.1056/NEJMoa1502214
  8. Zhang Z., Chen N., Yin N. et al. The rs1421085 variant within FTO promotes brown fat thermogenesis // Nat. Metab. 2023. V. 5. P. 1337–1351. https://doi.org/10.1038/s42255-023-00847-2
  9. Yin N., Zhang D., Wang J. The FTO variant conferring enhanced UCP1 expression is linked to human migration out of Africa // Life Metabolism. 2024. V. 3. https://doi.org/10.1093/lifemeta/loae027
  10. Попович А.А., Трифонова Е.А., Бочарова А.В. и др. Генетическое разнообразие в якутской популяции по локусам, ассоциированным с индексом массы тела и ожирением // Якутский мед. журнал. 2019. Т. 3. С. 23–26. https://doi.org/10.25789/YMJ.2019.67.06
  11. Иевлева К.Д., Баирова Т.А., Шенеман Е.А. и др. Вклад носительства полиморфных локусов генов энергетического обмена в метаболические нарушения у подростков двух этнических групп с избыточной массой тела // Бюл. эксперим. биол. и медицины. 2021. Т. 172. С. 440–444. https://doi.org/10.47056/0365-9615-2021-172-10-440-444
  12. Cardona A., Pagani L., Antao T. et al. Genome-wide analysis of cold adaption in indigenous Siberian populations // PLoS One. 2014. V. 9. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0098076
  13. Fumagalli M., Moltke I., Grarup N. et al. Greenlandic Inuit show genetic signatures of diet and climate adaptation // Science. 2015. V. 349. P. 1343–1347. https://doi.org/10.1126/science.aab2319
  14. Vallini L., Zampieri C., Shoaee M.J. et al. The Persian plateau served as hub for Homo sapiens after the main out of Africa dispersal // Nat. Commun. 2024. V. 15. P. 1882. https://doi.org/10.1038/s41467-024-46161-7

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
2. Рисунок. Распространение варианта rs1421085-C у населения мира. Черными точками на карте отмечены опорные точки (59 исследованных популяций). Справа показана шкала с интервалами значений частоты варианта полиморфизма (в %). Для визуализации распределения частоты аллеля rs1421085-C в географическом пространстве использован пакет программ Surfer (GoldenSoftware, LLC) (www.goldensoftware.com).

Скачать (255KB)
3. Рис. 1. Связь температуры января (TEMP – ось абсцисс) и частоты варианта rs1421085-C в популяциях коренного населения Сибири (FREQ – ось ординат). Коэффициент ранговой корреляции Спирмена r = –0.439, P = 0.244. Для корреляционного анализа использован пакет программ STATISTICA 10 (StatSoftInc.).

Скачать (111KB)
4. Рис. 2. Связь температуры июля (TEMP – ось абсцисс) и частоты варианта rs1421085-C в популяциях коренного населения Сибири (FREQ – ось ординат). Коэффициент ранговой корреляции Спирмена r = 0.506, P = 0.293.

Скачать (112KB)
5. Рис. 3. Связь температуры января (TEMP – ось абсцисс) и частоты варианта rs1421085-C в популяциях мира (FREQ – ось ординат). Коэффициент ранговой корреляции Спирмена r = –0.416, P = 0.00275.

Скачать (118KB)
6. Дополнительные материалы
Скачать (475KB)

© Российская академия наук, 2025

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».