A Study of the Structure of Trypsin-Like Serine Proteinases: 1. Study of Mini-Plasminogen Activation Using Tryptophan Fluorescence


Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Только для подписчиков

Аннотация

Abstract—It has been shown that the curve of the time dependence of tryptophan fluorescence during plasminogen activation by urokinase is well correlated with kinetic curves of activation, which were plotted according to both direct measurements of amidolytic activity of the forming plasmin and the analysis of the plasminogen cleavage products. Three curves represent the intercorrelation within a wide range of the pH and temperature change. We hypothesized that the fluorescence shift is caused by the changes in the Trp215 (Chymotrypsin numbering) side chain environment of activated plasmin. Plasmin activation via proteolytic cleavage of plasminogen induces rotation of the Trp215 side chain with subsequent translocation of the benzene ring of Trp215 from negatively charged (Asp194 and Glu143) to positively charged (Arg175) neighborhood. Our findings show that this rotation is not caused by the indol ring displacement from the substrate recognition pocket, which is provoked by the inhibitor or substrate binding. It has also been demonstrated that the conformation of plasminogen (at least relevant to Trp215 in the substrate recognition pocket) is not sensitive to the pH or temperature changes, while changes in fluorescence spectrum of plasmin correlate with its amidolytic activity.

Об авторах

T. Belyanko

National Medical Research Center of Cardiology

Email: Robert.Bibilashvili@gmail.com
Россия, Moscow, 121552

Ya. Gursky

National Medical Research Center of Cardiology

Email: Robert.Bibilashvili@gmail.com
Россия, Moscow, 121552

N. Dobrynina

National Medical Research Center of Cardiology

Email: Robert.Bibilashvili@gmail.com
Россия, Moscow, 121552

A. Orlova

National Medical Research Center of Cardiology

Email: Robert.Bibilashvili@gmail.com
Россия, Moscow, 121552

N. Rutkevich

National Medical Research Center of Cardiology

Email: Robert.Bibilashvili@gmail.com
Россия, Moscow, 121552

L. Savochkina

National Medical Research Center of Cardiology

Email: Robert.Bibilashvili@gmail.com
Россия, Moscow, 121552

A. Skamrov

National Medical Research Center of Cardiology

Email: Robert.Bibilashvili@gmail.com
Россия, Moscow, 121552

N. Skrypina

National Medical Research Center of Cardiology

Email: Robert.Bibilashvili@gmail.com
Россия, Moscow, 121552

R. Bibilashvilli

National Medical Research Center of Cardiology

Автор, ответственный за переписку.
Email: Robert.Bibilashvili@gmail.com
Россия, Moscow, 121552

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Pleiades Publishing, Inc., 2018

Согласие на обработку персональных данных с помощью сервиса «Яндекс.Метрика»

1. Я (далее – «Пользователь» или «Субъект персональных данных»), осуществляя использование сайта https://journals.rcsi.science/ (далее – «Сайт»), подтверждая свою полную дееспособность даю согласие на обработку персональных данных с использованием средств автоматизации Оператору - федеральному государственному бюджетному учреждению «Российский центр научной информации» (РЦНИ), далее – «Оператор», расположенному по адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А, со следующими условиями.

2. Категории обрабатываемых данных: файлы «cookies» (куки-файлы). Файлы «cookie» – это небольшой текстовый файл, который веб-сервер может хранить в браузере Пользователя. Данные файлы веб-сервер загружает на устройство Пользователя при посещении им Сайта. При каждом следующем посещении Пользователем Сайта «cookie» файлы отправляются на Сайт Оператора. Данные файлы позволяют Сайту распознавать устройство Пользователя. Содержимое такого файла может как относиться, так и не относиться к персональным данным, в зависимости от того, содержит ли такой файл персональные данные или содержит обезличенные технические данные.

3. Цель обработки персональных данных: анализ пользовательской активности с помощью сервиса «Яндекс.Метрика».

4. Категории субъектов персональных данных: все Пользователи Сайта, которые дали согласие на обработку файлов «cookie».

5. Способы обработки: сбор, запись, систематизация, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передача (доступ, предоставление), блокирование, удаление, уничтожение персональных данных.

6. Срок обработки и хранения: до получения от Субъекта персональных данных требования о прекращении обработки/отзыва согласия.

7. Способ отзыва: заявление об отзыве в письменном виде путём его направления на адрес электронной почты Оператора: info@rcsi.science или путем письменного обращения по юридическому адресу: 119991, г. Москва, Ленинский просп., д.32А

8. Субъект персональных данных вправе запретить своему оборудованию прием этих данных или ограничить прием этих данных. При отказе от получения таких данных или при ограничении приема данных некоторые функции Сайта могут работать некорректно. Субъект персональных данных обязуется сам настроить свое оборудование таким способом, чтобы оно обеспечивало адекватный его желаниям режим работы и уровень защиты данных файлов «cookie», Оператор не предоставляет технологических и правовых консультаций на темы подобного характера.

9. Порядок уничтожения персональных данных при достижении цели их обработки или при наступлении иных законных оснований определяется Оператором в соответствии с законодательством Российской Федерации.

10. Я согласен/согласна квалифицировать в качестве своей простой электронной подписи под настоящим Согласием и под Политикой обработки персональных данных выполнение мною следующего действия на сайте: https://journals.rcsi.science/ нажатие мною на интерфейсе с текстом: «Сайт использует сервис «Яндекс.Метрика» (который использует файлы «cookie») на элемент с текстом «Принять и продолжить».